RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419542.3

PCBP1-AS1-214, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 1,309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.35■■■■□ 3.09
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.52■■■□□ 2.48
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCC9O60706 1549 aa30.08■■■□□ 2.41
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.95■■■□□ 2.23
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.82■■■□□ 2.2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NACADO15069 1562 aa28.74■■■□□ 2.19
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.49■■■□□ 2.15
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.34■■■□□ 2.13
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.19■■■□□ 2.1
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.95■■■□□ 2.06
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SCRIBQ14160 1630 aa27.94■■■□□ 2.06
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.73■■■□□ 2.03
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.56■■■□□ 2
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.17■■□□□ 1.94
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.01■■□□□ 1.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SMARCA4P51532 1647 aa26.67■■□□□ 1.86
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.56■■□□□ 1.84
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NCAPD3P42695 1498 aa26.54■■□□□ 1.84
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.51■■□□□ 1.83
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SMARCA2P51531 1590 aa26.5■■□□□ 1.83
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HMGXB3Q12766 1538 aa26.37■■□□□ 1.81
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.36■■□□□ 1.81
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 WIZO95785 1651 aa26.23■■□□□ 1.79
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NESP48681 1621 aa26■■□□□ 1.75
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ERCC6Q03468 1493 aa25.94■■□□□ 1.74
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.8■■□□□ 1.72
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.72■■□□□ 1.71
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.67■■□□□ 1.7
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.64■■□□□ 1.7
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CUX2O14529 1486 aa25.61■■□□□ 1.69
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CFTRP13569 1480 aa25.59■■□□□ 1.69
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.51■■□□□ 1.67
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.48■■□□□ 1.67
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.44■■□□□ 1.66
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PRDM2Q13029 1718 aa25.38■■□□□ 1.65
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 WDR62O43379 1518 aa25.33■■□□□ 1.65
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TOPBP1Q92547 1522 aa25.08■■□□□ 1.6
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCC8Q09428 1581 aa25.04■■□□□ 1.6
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.02■■□□□ 1.6
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.01■■□□□ 1.59
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 IFT140Q96RY7 1462 aa24.93■■□□□ 1.58
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CUX1P39880 1505 aa24.86■■□□□ 1.57
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SOGA1O94964 1423 aa24.8■■□□□ 1.56
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.8■■□□□ 1.56
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.8■■□□□ 1.56
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 OSCARQ8IYS5 282 aa24.63■■□□□ 1.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SYNJ1O43426 1573 aa24.62■■□□□ 1.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TOP2BQ02880 1626 aa24.61■■□□□ 1.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.58■■□□□ 1.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FBLN2P98095 1184 aa24.55■■□□□ 1.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 WDR97A6NE52 1622 aa24.54■■□□□ 1.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.52■■□□□ 1.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.49■■□□□ 1.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GRIN2BQ13224 1484 aa24.48■■□□□ 1.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.47■■□□□ 1.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CHD1O14646 1710 aa24.46■■□□□ 1.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PBRM1Q86U86 1689 aa24.42■■□□□ 1.5
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.42■■□□□ 1.5
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SYNJ2O15056 1496 aa24.32■■□□□ 1.48
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TRIM41Q8WV44 630 aa24.25■■□□□ 1.47
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.22■■□□□ 1.47
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.2■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.2■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.2■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ADAMTS12P58397 1594 aa24.2■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ARHGEF11O15085 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KIF27Q86VH2 1401 aa24.17■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GRIN2AQ12879 1464 aa24.16■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.14■■□□□ 1.46
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 IGF1RP08069 1367 aa24.1■■□□□ 1.45
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.07■■□□□ 1.44
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CEP170Q5SW79 1584 aa24.05■■□□□ 1.44
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NUP160Q12769 1436 aa24.03■■□□□ 1.44
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CUL7Q14999 1698 aa23.98■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.97■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ARAP1Q96P48 1450 aa23.97■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.96■■□□□ 1.43
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 JPH4Q96JJ6 628 aa23.88■■□□□ 1.41
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.87■■□□□ 1.41
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