RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561547.5

ATP2A1-AS1-201, ATP2A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATP2A1-AS1, Length 558 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.63■■■□□ 2.97
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ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 SCRIBQ14160 1630 aa27.66■■■□□ 2.02
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
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ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 SMARCA4P51532 1647 aa26.3■■□□□ 1.8
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ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.47■■□□□ 1.67
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ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 ADAMTS12P58397 1594 aa23.98■■□□□ 1.43
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 CEP170Q5SW79 1584 aa23.98■■□□□ 1.43
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 NUP160Q12769 1436 aa23.97■■□□□ 1.43
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.92■■□□□ 1.42
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 TOP2BQ02880 1626 aa23.88■■□□□ 1.41
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 SHROOM2Q13796 1616 aa23.86■■□□□ 1.41
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.86■■□□□ 1.41
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.82■■□□□ 1.4
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ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 JPH4Q96JJ6 628 aa23.78■■□□□ 1.4
ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.7■■□□□ 1.39
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