Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAJB4Q9UDY4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAJB4Q9UDY4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms