Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC4Q8WW27 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms