Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 FN3KRP-207ENST00000574832 1422 ntTSL 217.94■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 FN3KRP-206ENST00000574356 887 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-205ENST00000475036 1045 ntTSL 316.97■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-206ENST00000476464 2052 ntTSL 216.6■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-212ENST00000497323 717 ntTSL 516.35■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 FN3KRP-204ENST00000573158 627 ntTSL 315.83■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 FN3KRP-205ENST00000574206 683 ntTSL 315.56■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 FN3KRP-209ENST00000577128 515 ntTSL 511.24□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-207ENST00000478185 469 ntTSL 59.9□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 CHD6-204ENST00000440647 536 ntTSL 35.44□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.732e-6■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 39.67□□□□□ -0.863e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 58.53□□□□□ -1.043e-7■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.074e-26■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.034e-26■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.834e-26■■■■□ 22.7
TIAL1Q01085 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.23e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.423e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.683e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.023e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.497e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.037e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.27e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.217e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.217e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.537e-8■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 57.54□□□□□ -1.21e-6■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.641e-6■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)4.58□□□□□ -1.681e-6■■■■□ 22.6
TIAL1Q01085 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.774e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-212ENST00000509333 743 ntTSL 215.59■□□□□ 0.094e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-216ENST00000511767 463 ntTSL 515.59■□□□□ 0.094e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.024e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-220ENST00000514830 802 ntTSL 211.78□□□□□ -0.524e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-208ENST00000504489 538 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.624e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-217ENST00000512274 372 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.774e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.884e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-223ENST00000627587 1853 ntTSL 29.47□□□□□ -0.894e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-207ENST00000503974 2081 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.994e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.064e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.114e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.264e-8■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-17■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-17■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 313.6□□□□□ -0.233e-17■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-17■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-17■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-9■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-9■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-9■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)8.33□□□□□ -1.081e-9■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 WSB1-212ENST00000583096 834 ntTSL 35.35□□□□□ -1.551e-9■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 33.1□□□□□ -1.911e-9■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.237e-7■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.217e-7■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 515.29■□□□□ 0.047e-7■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.387e-7■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.051e-18■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.5
TIAL1Q01085 NOC3L-203ENST00000463649 2190 ntTSL 25.36□□□□□ -1.552e-6■■■■□ 22.4
TIAL1Q01085 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.992e-6■■■■□ 22.4
TIAL1Q01085 ACSL3-211ENST00000542810 428 ntTSL 27.11□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 22.4
TIAL1Q01085 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 22.4
TIAL1Q01085 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.551e-7■■■■□ 22.4
TIAL1Q01085 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-9■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-9■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-9■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 PTGES3-206ENST00000537473 2939 ntTSL 213.74□□□□□ -0.211e-9■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 217.03■□□□□ 0.324e-7■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TYW5-202ENST00000441832 2042 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TYW5-204ENST00000483328 4287 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TCF7L2-207ENST00000369386 1274 ntTSL 57.23□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TYW5-205ENST00000493181 6525 ntTSL 1 (best)6.65□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TCF7L2-201ENST00000277945 620 ntTSL 56.01□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TYW5-203ENST00000452512 2557 ntTSL 24.4□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 22.3
TIAL1Q01085 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.356e-15■■■■□ 22.2
TIAL1Q01085 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.016e-15■■■■□ 22.2
TIAL1Q01085 LUC7L3-203ENST00000503728 783 ntTSL 55.4□□□□□ -1.546e-15■■■■□ 22.2
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 95.8 ms