Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYGBP11216 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYGBP11216 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PYGBP11216 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYGBP11216 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYGBP11216 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYGBP11216 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYGBP11216 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYGBP11216 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYGBP11216 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYGBP11216 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYGBP11216 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYGBP11216 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYGBP11216 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYGBP11216 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYGBP11216 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYGBP11216 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYGBP11216 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYGBP11216 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PYGBP11216 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PYGBP11216 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYGBP11216 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms