Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH22Q9UJ99 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms