Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms