RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399208.6

SETD4-205, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-205ENST00000399208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.26■■■■□ 3.56
SETD4-205ENST00000399208 ABCC9O60706 1549 aa33.85■■■■□ 3.01
SETD4-205ENST00000399208 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.57■■■□□ 2.97
SETD4-205ENST00000399208 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.11■■■□□ 2.73
SETD4-205ENST00000399208 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.04■■■□□ 2.72
SETD4-205ENST00000399208 NACADO15069 1562 aa31.83■■■□□ 2.69
SETD4-205ENST00000399208 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.6■■■□□ 2.65
SETD4-205ENST00000399208 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.47■■■□□ 2.63
SETD4-205ENST00000399208 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.36■■■□□ 2.61
SETD4-205ENST00000399208 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.3■■■□□ 2.6
SETD4-205ENST00000399208 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.17■■■□□ 2.58
SETD4-205ENST00000399208 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
SETD4-205ENST00000399208 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.78■■■□□ 2.52
SETD4-205ENST00000399208 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.75■■■□□ 2.51
SETD4-205ENST00000399208 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.57■■■□□ 2.48
SETD4-205ENST00000399208 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.54■■■□□ 2.48
SETD4-205ENST00000399208 SCRIBQ14160 1630 aa30.54■■■□□ 2.48
SETD4-205ENST00000399208 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
SETD4-205ENST00000399208 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.68■■■□□ 2.34
SETD4-205ENST00000399208 NCAPD3P42695 1498 aa29.39■■■□□ 2.3
SETD4-205ENST00000399208 CUX2O14529 1486 aa29.33■■■□□ 2.29
SETD4-205ENST00000399208 ERCC6Q03468 1493 aa29.27■■■□□ 2.28
SETD4-205ENST00000399208 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.23■■■□□ 2.27
SETD4-205ENST00000399208 SMARCA2P51531 1590 aa29.16■■■□□ 2.26
SETD4-205ENST00000399208 HMGXB3Q12766 1538 aa29.13■■■□□ 2.25
SETD4-205ENST00000399208 SMARCA4P51532 1647 aa29.12■■■□□ 2.25
SETD4-205ENST00000399208 NESP48681 1621 aa28.98■■■□□ 2.23
SETD4-205ENST00000399208 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
SETD4-205ENST00000399208 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SETD4-205ENST00000399208 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.86■■■□□ 2.21
SETD4-205ENST00000399208 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.77■■■□□ 2.2
SETD4-205ENST00000399208 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SETD4-205ENST00000399208 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.69■■■□□ 2.18
SETD4-205ENST00000399208 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.63■■■□□ 2.17
SETD4-205ENST00000399208 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.61■■■□□ 2.17
SETD4-205ENST00000399208 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.48■■■□□ 2.15
SETD4-205ENST00000399208 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.37■■■□□ 2.13
SETD4-205ENST00000399208 WIZO95785 1651 aa28.34■■■□□ 2.13
SETD4-205ENST00000399208 WDR62O43379 1518 aa28.31■■■□□ 2.12
SETD4-205ENST00000399208 TRIM41Q8WV44 630 aa28.22■■■□□ 2.11
SETD4-205ENST00000399208 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.2■■■□□ 2.1
SETD4-205ENST00000399208 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.14■■■□□ 2.09
SETD4-205ENST00000399208 CFTRP13569 1480 aa28.08■■■□□ 2.09
SETD4-205ENST00000399208 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SETD4-205ENST00000399208 OSCARQ8IYS5 282 aa27.97■■■□□ 2.07
SETD4-205ENST00000399208 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SETD4-205ENST00000399208 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SETD4-205ENST00000399208 PRDM2Q13029 1718 aa27.77■■■□□ 2.04
SETD4-205ENST00000399208 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.66■■■□□ 2.02
SETD4-205ENST00000399208 IFT140Q96RY7 1462 aa27.65■■■□□ 2.02
SETD4-205ENST00000399208 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
SETD4-205ENST00000399208 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
SETD4-205ENST00000399208 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
SETD4-205ENST00000399208 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
SETD4-205ENST00000399208 TOPBP1Q92547 1522 aa27.57■■■□□ 2
SETD4-205ENST00000399208 ABCC8Q09428 1581 aa27.53■■■□□ 2
SETD4-205ENST00000399208 ARHGEF11O15085 1522 aa27.47■■□□□ 1.99
SETD4-205ENST00000399208 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
SETD4-205ENST00000399208 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.44■■□□□ 1.98
SETD4-205ENST00000399208 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SETD4-205ENST00000399208 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.973e-7■■■■□ 24
SETD4-205ENST00000399208 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.32■■□□□ 1.96
SETD4-205ENST00000399208 CHD1O14646 1710 aa27.31■■□□□ 1.96
SETD4-205ENST00000399208 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SETD4-205ENST00000399208 FBLN2P98095 1184 aa27.25■■□□□ 1.95
SETD4-205ENST00000399208 ARAP1Q96P48 1450 aa27.18■■□□□ 1.94
SETD4-205ENST00000399208 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.17■■□□□ 1.94
SETD4-205ENST00000399208 SOGA1O94964 1423 aa27.16■■□□□ 1.94
SETD4-205ENST00000399208 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SETD4-205ENST00000399208 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SETD4-205ENST00000399208 WDR97A6NE52 1622 aa27.08■■□□□ 1.93
SETD4-205ENST00000399208 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.05■■□□□ 1.92
SETD4-205ENST00000399208 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.05■■□□□ 1.92
SETD4-205ENST00000399208 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 CLASP1Q7Z460 1538 aa27■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 CUX1P39880 1505 aa26.97■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 SYNJ1O43426 1573 aa26.97■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 GRIN2BQ13224 1484 aa26.95■■□□□ 1.91
SETD4-205ENST00000399208 SYNJ2O15056 1496 aa26.9■■□□□ 1.9
SETD4-205ENST00000399208 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.81■■□□□ 1.88
SETD4-205ENST00000399208 PBRM1Q86U86 1689 aa26.81■■□□□ 1.88
SETD4-205ENST00000399208 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.75■■□□□ 1.87
SETD4-205ENST00000399208 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.71■■□□□ 1.87
SETD4-205ENST00000399208 GRIN2AQ12879 1464 aa26.6■■□□□ 1.85
SETD4-205ENST00000399208 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
SETD4-205ENST00000399208 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SETD4-205ENST00000399208 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SETD4-205ENST00000399208 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.54■■□□□ 1.84
SETD4-205ENST00000399208 ADAMTS12P58397 1594 aa26.53■■□□□ 1.84
SETD4-205ENST00000399208 NUP160Q12769 1436 aa26.52■■□□□ 1.84
SETD4-205ENST00000399208 CEP170Q5SW79 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
SETD4-205ENST00000399208 TOP2BQ02880 1626 aa26.47■■□□□ 1.83
SETD4-205ENST00000399208 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.47■■□□□ 1.83
SETD4-205ENST00000399208 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.47■■□□□ 1.83
SETD4-205ENST00000399208 SHROOM2Q13796 1616 aa26.44■■□□□ 1.82
SETD4-205ENST00000399208 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.41■■□□□ 1.82
SETD4-205ENST00000399208 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SETD4-205ENST00000399208 JPH4Q96JJ6 628 aa26.28■■□□□ 1.8
SETD4-205ENST00000399208 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms