Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms