Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN25C9JDP6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms