RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325064.9

MTSS1-201, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

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Gene MTSS1, Length 2,777 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-201ENST00000325064 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.28■■□□□ 1.96
MTSS1-201ENST00000325064 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.45■■□□□ 1.34
MTSS1-201ENST00000325064 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.98■■□□□ 1.27
MTSS1-201ENST00000325064 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MTSS1-201ENST00000325064 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.92■■□□□ 1.26
MTSS1-201ENST00000325064 HRCP23327 699 aa22.54■■□□□ 1.2
MTSS1-201ENST00000325064 ABCC9O60706 1549 aa22.43■■□□□ 1.18
MTSS1-201ENST00000325064 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.31■■□□□ 1.16
MTSS1-201ENST00000325064 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
MTSS1-201ENST00000325064 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.09■■□□□ 1.13
MTSS1-201ENST00000325064 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.01■■□□□ 1.11
MTSS1-201ENST00000325064 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.99■■□□□ 1.11
MTSS1-201ENST00000325064 SCRIBQ14160 1630 aa21.97■■□□□ 1.11
MTSS1-201ENST00000325064 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MTSS1-201ENST00000325064 NACADO15069 1562 aa21.86■■□□□ 1.09
MTSS1-201ENST00000325064 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
MTSS1-201ENST00000325064 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.67■■□□□ 1.06
MTSS1-201ENST00000325064 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
MTSS1-201ENST00000325064 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.39■■□□□ 1.01
MTSS1-201ENST00000325064 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.014e-8■□□□□ 9.7
MTSS1-201ENST00000325064 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
MTSS1-201ENST00000325064 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.36■■□□□ 1.01
MTSS1-201ENST00000325064 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.34■■□□□ 1.01
MTSS1-201ENST00000325064 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
MTSS1-201ENST00000325064 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.22■□□□□ 0.99
MTSS1-201ENST00000325064 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
MTSS1-201ENST00000325064 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.12■□□□□ 0.97
MTSS1-201ENST00000325064 WIZO95785 1651 aa21.07■□□□□ 0.96
MTSS1-201ENST00000325064 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
MTSS1-201ENST00000325064 SMARCA4P51532 1647 aa20.91■□□□□ 0.94
MTSS1-201ENST00000325064 MYT1Q01538 1121 aa20.84■□□□□ 0.93
MTSS1-201ENST00000325064 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
MTSS1-201ENST00000325064 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
MTSS1-201ENST00000325064 NEUROD1Q13562 356 aa20.66■□□□□ 0.9
MTSS1-201ENST00000325064 TRIM41Q8WV44 630 aa20.66■□□□□ 0.9
MTSS1-201ENST00000325064 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.62■□□□□ 0.89
MTSS1-201ENST00000325064 SMARCA2P51531 1590 aa20.56■□□□□ 0.88
MTSS1-201ENST00000325064 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.56■□□□□ 0.88
MTSS1-201ENST00000325064 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
MTSS1-201ENST00000325064 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.52■□□□□ 0.88
MTSS1-201ENST00000325064 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
MTSS1-201ENST00000325064 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.49■□□□□ 0.87
MTSS1-201ENST00000325064 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
MTSS1-201ENST00000325064 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
MTSS1-201ENST00000325064 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
MTSS1-201ENST00000325064 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.43■□□□□ 0.86
MTSS1-201ENST00000325064 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
MTSS1-201ENST00000325064 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
MTSS1-201ENST00000325064 ABCC8Q09428 1581 aa20.38■□□□□ 0.85
MTSS1-201ENST00000325064 NCAPD3P42695 1498 aa20.25■□□□□ 0.83
MTSS1-201ENST00000325064 HMGXB3Q12766 1538 aa20.16■□□□□ 0.82
MTSS1-201ENST00000325064 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.14■□□□□ 0.82
MTSS1-201ENST00000325064 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
MTSS1-201ENST00000325064 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
MTSS1-201ENST00000325064 SOGA1O94964 1423 aa20.06■□□□□ 0.8
MTSS1-201ENST00000325064 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.02■□□□□ 0.8
MTSS1-201ENST00000325064 SYNJ1O43426 1573 aa20.01■□□□□ 0.79
MTSS1-201ENST00000325064 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.96■□□□□ 0.79
MTSS1-201ENST00000325064 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
MTSS1-201ENST00000325064 CFTRP13569 1480 aa19.91■□□□□ 0.78
MTSS1-201ENST00000325064 MIER1Q8N108 512 aa19.9■□□□□ 0.78
MTSS1-201ENST00000325064 CEP162Q5TB80 1403 aa19.89■□□□□ 0.78
MTSS1-201ENST00000325064 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.87■□□□□ 0.77
MTSS1-201ENST00000325064 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
MTSS1-201ENST00000325064 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.85■□□□□ 0.77
MTSS1-201ENST00000325064 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.82■□□□□ 0.76
MTSS1-201ENST00000325064 CUX1P39880 1505 aa19.79■□□□□ 0.76
MTSS1-201ENST00000325064 NESP48681 1621 aa19.78■□□□□ 0.76
MTSS1-201ENST00000325064 TOP2BQ02880 1626 aa19.78■□□□□ 0.76
MTSS1-201ENST00000325064 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
MTSS1-201ENST00000325064 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.73■□□□□ 0.75
MTSS1-201ENST00000325064 EEA1Q15075 1411 aa19.72■□□□□ 0.75
MTSS1-201ENST00000325064 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.7■□□□□ 0.74
MTSS1-201ENST00000325064 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
MTSS1-201ENST00000325064 PRDM2Q13029 1718 aa19.66■□□□□ 0.74
MTSS1-201ENST00000325064 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.66■□□□□ 0.74
MTSS1-201ENST00000325064 GOLGA3Q08378 1498 aa19.61■□□□□ 0.73
MTSS1-201ENST00000325064 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
MTSS1-201ENST00000325064 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.58■□□□□ 0.73
MTSS1-201ENST00000325064 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
MTSS1-201ENST00000325064 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.56■□□□□ 0.72
MTSS1-201ENST00000325064 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.54■□□□□ 0.72
MTSS1-201ENST00000325064 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.52■□□□□ 0.72
MTSS1-201ENST00000325064 KIF27Q86VH2 1401 aa19.51■□□□□ 0.71
MTSS1-201ENST00000325064 KIF21BO75037 1637 aa19.51■□□□□ 0.71
MTSS1-201ENST00000325064 CUX2O14529 1486 aa19.5■□□□□ 0.71
MTSS1-201ENST00000325064 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.5■□□□□ 0.71
MTSS1-201ENST00000325064 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.47■□□□□ 0.71
MTSS1-201ENST00000325064 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.47■□□□□ 0.71
MTSS1-201ENST00000325064 TOPBP1Q92547 1522 aa19.45■□□□□ 0.7
MTSS1-201ENST00000325064 PRXQ9BXM0 1461 aa19.42■□□□□ 0.7
MTSS1-201ENST00000325064 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
MTSS1-201ENST00000325064 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.41■□□□□ 0.7
MTSS1-201ENST00000325064 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.4■□□□□ 0.7
MTSS1-201ENST00000325064 CLIP1P30622 1438 aa19.4■□□□□ 0.7
MTSS1-201ENST00000325064 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.7
MTSS1-201ENST00000325064 IGF1RP08069 1367 aa19.39■□□□□ 0.69
MTSS1-201ENST00000325064 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.39■□□□□ 0.69
MTSS1-201ENST00000325064 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.39■□□□□ 0.69
MTSS1-201ENST00000325064 BCL11AQ9H165 835 aa19.36■□□□□ 0.69
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