Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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