Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms