RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420520.1

DDX39B-AS1-208, DDX39B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene DDX39B-AS1, Length 516 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.5■■■□□ 2.79
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.82■■■□□ 2.04
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 NACADO15069 1562 aa27.62■■■□□ 2.01
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.61■■■□□ 2.01
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.03■■□□□ 1.92
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.93■■□□□ 1.9
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SCRIBQ14160 1630 aa26.65■■□□□ 1.86
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.61■■□□□ 1.85
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.48■■□□□ 1.83
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.44■■□□□ 1.82
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ERCC6Q03468 1493 aa25.46■■□□□ 1.67
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.44■■□□□ 1.66
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SMARCA2P51531 1590 aa25.37■■□□□ 1.65
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SMARCA4P51532 1647 aa25.34■■□□□ 1.65
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CUX2O14529 1486 aa25.31■■□□□ 1.64
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 HMGXB3Q12766 1538 aa25.27■■□□□ 1.64
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.05■■□□□ 1.6
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.02■■□□□ 1.6
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.93■■□□□ 1.58
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.8■■□□□ 1.56
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.75■■□□□ 1.55
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 WIZO95785 1651 aa24.72■■□□□ 1.55
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.65■■□□□ 1.54
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.56■■□□□ 1.52
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.51■■□□□ 1.51
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 WDR62O43379 1518 aa24.51■■□□□ 1.51
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 TRIM41Q8WV44 630 aa24.48■■□□□ 1.51
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CFTRP13569 1480 aa24.44■■□□□ 1.5
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 OSCARQ8IYS5 282 aa24.28■■□□□ 1.48
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.19■■□□□ 1.46
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 IFT140Q96RY7 1462 aa24.07■■□□□ 1.44
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 PRDM2Q13029 1718 aa24.03■■□□□ 1.44
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 TOPBP1Q92547 1522 aa24■■□□□ 1.43
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 FBLN2P98095 1184 aa23.88■■□□□ 1.41
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.8■■□□□ 1.4
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.8■■□□□ 1.4
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.8■■□□□ 1.4
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.76■■□□□ 1.39
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ARHGEF11O15085 1522 aa23.75■■□□□ 1.39
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.62■■□□□ 1.37
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.56■■□□□ 1.36
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ARAP1Q96P48 1450 aa23.5■■□□□ 1.35
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 GRIN2BQ13224 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 WDR97A6NE52 1622 aa23.47■■□□□ 1.35
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SYNJ1O43426 1573 aa23.43■■□□□ 1.34
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DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SYNJ2O15056 1496 aa23.4■■□□□ 1.34
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.36■■□□□ 1.33
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.31■■□□□ 1.32
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 PBRM1Q86U86 1689 aa23.27■■□□□ 1.32
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.21■■□□□ 1.31
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 GRIN2AQ12879 1464 aa23.17■■□□□ 1.3
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.11■■□□□ 1.29
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 TOP2BQ02880 1626 aa23.11■■□□□ 1.29
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ADAMTS12P58397 1594 aa23.08■■□□□ 1.29
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.06■■□□□ 1.28
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 NUP160Q12769 1436 aa23.06■■□□□ 1.28
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 CEP170Q5SW79 1584 aa23.03■■□□□ 1.28
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.01■■□□□ 1.27
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.01■■□□□ 1.27
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 JPH4Q96JJ6 628 aa22.96■■□□□ 1.27
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
DDX39B-AS1-208ENST00000420520 SHROOM2Q13796 1616 aa22.87■■□□□ 1.25
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