RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.89■■■□□ 2.7
SNX15-201ENST00000352068 ABCC9O60706 1549 aa30.09■■■□□ 2.41
SNX15-201ENST00000352068 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.21■■■□□ 2.27
SNX15-201ENST00000352068 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.08■■■□□ 2.25
SNX15-201ENST00000352068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.22■■■□□ 2.11
SNX15-201ENST00000352068 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
SNX15-201ENST00000352068 NACADO15069 1562 aa27.77■■■□□ 2.04
SNX15-201ENST00000352068 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.68■■■□□ 2.02
SNX15-201ENST00000352068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.53■■■□□ 2
SNX15-201ENST00000352068 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.4■■□□□ 1.98
SNX15-201ENST00000352068 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.39■■□□□ 1.98
SNX15-201ENST00000352068 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
SNX15-201ENST00000352068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.15■■□□□ 1.94
SNX15-201ENST00000352068 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.07■■□□□ 1.92
SNX15-201ENST00000352068 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27■■□□□ 1.91
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SNX15-201ENST00000352068 CUX2O14529 1486 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX15-201ENST00000352068 SCRIBQ14160 1630 aa26.37■■□□□ 1.81
SNX15-201ENST00000352068 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.31■■□□□ 1.8
SNX15-201ENST00000352068 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SNX15-201ENST00000352068 ERCC6Q03468 1493 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX15-201ENST00000352068 TRIM41Q8WV44 630 aa25.95■■□□□ 1.74
SNX15-201ENST00000352068 NCAPD3P42695 1498 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX15-201ENST00000352068 NESP48681 1621 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX15-201ENST00000352068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SNX15-201ENST00000352068 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX15-201ENST00000352068 HMGXB3Q12766 1538 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-201ENST00000352068 SMARCA2P51531 1590 aa25.3■■□□□ 1.64
SNX15-201ENST00000352068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-201ENST00000352068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-201ENST00000352068 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-201ENST00000352068 OSCARQ8IYS5 282 aa25.1■■□□□ 1.61
SNX15-201ENST00000352068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SNX15-201ENST00000352068 SMARCA4P51532 1647 aa25.08■■□□□ 1.61
SNX15-201ENST00000352068 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SNX15-201ENST00000352068 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.96■■□□□ 1.59
SNX15-201ENST00000352068 WDR62O43379 1518 aa24.93■■□□□ 1.58
SNX15-201ENST00000352068 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.88■■□□□ 1.57
SNX15-201ENST00000352068 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX15-201ENST00000352068 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-201ENST00000352068 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-201ENST00000352068 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-201ENST00000352068 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SNX15-201ENST00000352068 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.64■■□□□ 1.54
SNX15-201ENST00000352068 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX15-201ENST00000352068 ARHGEF11O15085 1522 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-201ENST00000352068 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX15-201ENST00000352068 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.53■■□□□ 1.52
SNX15-201ENST00000352068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX15-201ENST00000352068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SNX15-201ENST00000352068 CFTRP13569 1480 aa24.31■■□□□ 1.48
SNX15-201ENST00000352068 ARAP1Q96P48 1450 aa24.29■■□□□ 1.48
SNX15-201ENST00000352068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SNX15-201ENST00000352068 IFT140Q96RY7 1462 aa24.22■■□□□ 1.47
SNX15-201ENST00000352068 WIZO95785 1651 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX15-201ENST00000352068 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SNX15-201ENST00000352068 CHD1O14646 1710 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX15-201ENST00000352068 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SNX15-201ENST00000352068 FBLN2P98095 1184 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX15-201ENST00000352068 PRDM2Q13029 1718 aa23.94■■□□□ 1.42
SNX15-201ENST00000352068 TOPBP1Q92547 1522 aa23.93■■□□□ 1.42
SNX15-201ENST00000352068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
SNX15-201ENST00000352068 ABCC8Q09428 1581 aa23.87■■□□□ 1.41
SNX15-201ENST00000352068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SNX15-201ENST00000352068 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SNX15-201ENST00000352068 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SNX15-201ENST00000352068 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX15-201ENST00000352068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.74■■□□□ 1.39
SNX15-201ENST00000352068 SYNJ1O43426 1573 aa23.7■■□□□ 1.38
SNX15-201ENST00000352068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SNX15-201ENST00000352068 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX15-201ENST00000352068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX15-201ENST00000352068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX15-201ENST00000352068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SNX15-201ENST00000352068 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.56■■□□□ 1.36
SNX15-201ENST00000352068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SNX15-201ENST00000352068 WDR97A6NE52 1622 aa23.53■■□□□ 1.36
SNX15-201ENST00000352068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.53■■□□□ 1.36
SNX15-201ENST00000352068 SOGA1O94964 1423 aa23.52■■□□□ 1.36
SNX15-201ENST00000352068 SYNJ2O15056 1496 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX15-201ENST00000352068 GRIN2BQ13224 1484 aa23.43■■□□□ 1.34
SNX15-201ENST00000352068 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX15-201ENST00000352068 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.39■■□□□ 1.33
SNX15-201ENST00000352068 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.3■■□□□ 1.32
SNX15-201ENST00000352068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.3■■□□□ 1.32
SNX15-201ENST00000352068 PBRM1Q86U86 1689 aa23.22■■□□□ 1.31
SNX15-201ENST00000352068 CEP170Q5SW79 1584 aa23.2■■□□□ 1.3
SNX15-201ENST00000352068 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.2■■□□□ 1.3
SNX15-201ENST00000352068 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.16■■□□□ 1.3
SNX15-201ENST00000352068 KDM6BO15054 1643 aa23.12■■□□□ 1.29
SNX15-201ENST00000352068 GRIN2AQ12879 1464 aa23.11■■□□□ 1.29
SNX15-201ENST00000352068 CUX1P39880 1505 aa23.1■■□□□ 1.29
SNX15-201ENST00000352068 NUP160Q12769 1436 aa23.09■■□□□ 1.29
SNX15-201ENST00000352068 SHROOM2Q13796 1616 aa23.09■■□□□ 1.29
SNX15-201ENST00000352068 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
SNX15-201ENST00000352068 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.04■■□□□ 1.28
SNX15-201ENST00000352068 DIP2BQ9P265 1576 aa23.02■■□□□ 1.28
SNX15-201ENST00000352068 MAPKBP1O60336 1514 aa23.02■■□□□ 1.28
SNX15-201ENST00000352068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.01■■□□□ 1.27
SNX15-201ENST00000352068 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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