Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPHB3P54753 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms