Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms