RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320063.10

GIT2-201, Transcript of GIT ArfGAP 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GIT2, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT2-201ENST00000320063 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.12■■■□□ 2.57
GIT2-201ENST00000320063 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.88■■□□□ 1.89
GIT2-201ENST00000320063 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
GIT2-201ENST00000320063 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.86■■□□□ 1.73
GIT2-201ENST00000320063 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.81■■□□□ 1.72
GIT2-201ENST00000320063 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.64■■□□□ 1.7
GIT2-201ENST00000320063 ABCC9O60706 1549 aa25.24■■□□□ 1.63
GIT2-201ENST00000320063 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.17■■□□□ 1.62
GIT2-201ENST00000320063 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
GIT2-201ENST00000320063 NACADO15069 1562 aa24.98■■□□□ 1.59
GIT2-201ENST00000320063 SCRIBQ14160 1630 aa24.92■■□□□ 1.58
GIT2-201ENST00000320063 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.7■■□□□ 1.54
GIT2-201ENST00000320063 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GIT2-201ENST00000320063 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.24■■□□□ 1.47
GIT2-201ENST00000320063 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.2■■□□□ 1.47
GIT2-201ENST00000320063 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.13■■□□□ 1.45
GIT2-201ENST00000320063 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.09■■□□□ 1.45
GIT2-201ENST00000320063 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GIT2-201ENST00000320063 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.95■■□□□ 1.42
GIT2-201ENST00000320063 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
GIT2-201ENST00000320063 WIZO95785 1651 aa23.94■■□□□ 1.42
GIT2-201ENST00000320063 SMARCA4P51532 1647 aa23.85■■□□□ 1.41
GIT2-201ENST00000320063 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
GIT2-201ENST00000320063 TRIM41Q8WV44 630 aa23.5■■□□□ 1.35
GIT2-201ENST00000320063 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.46■■□□□ 1.35
GIT2-201ENST00000320063 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.46■■□□□ 1.35
GIT2-201ENST00000320063 SMARCA2P51531 1590 aa23.44■■□□□ 1.34
GIT2-201ENST00000320063 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.36■■□□□ 1.33
GIT2-201ENST00000320063 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GIT2-201ENST00000320063 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.3■■□□□ 1.32
GIT2-201ENST00000320063 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GIT2-201ENST00000320063 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GIT2-201ENST00000320063 ABCC8Q09428 1581 aa23.13■■□□□ 1.29
GIT2-201ENST00000320063 NCAPD3P42695 1498 aa23.06■■□□□ 1.28
GIT2-201ENST00000320063 HMGXB3Q12766 1538 aa23.05■■□□□ 1.28
GIT2-201ENST00000320063 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.91■■□□□ 1.26
GIT2-201ENST00000320063 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
GIT2-201ENST00000320063 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
GIT2-201ENST00000320063 SOGA1O94964 1423 aa22.78■■□□□ 1.24
GIT2-201ENST00000320063 SYNJ1O43426 1573 aa22.78■■□□□ 1.24
GIT2-201ENST00000320063 EEA1Q15075 1411 aa22.72■■□□□ 1.23
GIT2-201ENST00000320063 CFTRP13569 1480 aa22.67■■□□□ 1.22
GIT2-201ENST00000320063 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.67■■□□□ 1.22
GIT2-201ENST00000320063 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.67■■□□□ 1.22
GIT2-201ENST00000320063 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.65■■□□□ 1.22
GIT2-201ENST00000320063 TOP2BQ02880 1626 aa22.62■■□□□ 1.21
GIT2-201ENST00000320063 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.57■■□□□ 1.2
GIT2-201ENST00000320063 PRDM2Q13029 1718 aa22.56■■□□□ 1.2
GIT2-201ENST00000320063 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.55■■□□□ 1.2
GIT2-201ENST00000320063 CUX1P39880 1505 aa22.5■■□□□ 1.19
GIT2-201ENST00000320063 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
GIT2-201ENST00000320063 GOLGA3Q08378 1498 aa22.48■■□□□ 1.19
GIT2-201ENST00000320063 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GIT2-201ENST00000320063 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.47■■□□□ 1.19
GIT2-201ENST00000320063 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.43■■□□□ 1.18
GIT2-201ENST00000320063 CEP162Q5TB80 1403 aa22.42■■□□□ 1.18
GIT2-201ENST00000320063 KIF21BO75037 1637 aa22.41■■□□□ 1.18
GIT2-201ENST00000320063 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.32■■□□□ 1.16
GIT2-201ENST00000320063 KIF27Q86VH2 1401 aa22.28■■□□□ 1.16
GIT2-201ENST00000320063 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.28■■□□□ 1.16
GIT2-201ENST00000320063 NESP48681 1621 aa22.27■■□□□ 1.16
GIT2-201ENST00000320063 HRCP23327 699 aa22.26■■□□□ 1.15
GIT2-201ENST00000320063 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GIT2-201ENST00000320063 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.21■■□□□ 1.15
GIT2-201ENST00000320063 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.2■■□□□ 1.14
GIT2-201ENST00000320063 PRXQ9BXM0 1461 aa22.19■■□□□ 1.14
GIT2-201ENST00000320063 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.19■■□□□ 1.14
GIT2-201ENST00000320063 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.18■■□□□ 1.14
GIT2-201ENST00000320063 CLIP1P30622 1438 aa22.16■■□□□ 1.14
GIT2-201ENST00000320063 CUX2O14529 1486 aa22.16■■□□□ 1.14
GIT2-201ENST00000320063 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.15■■□□□ 1.14
GIT2-201ENST00000320063 TOPBP1Q92547 1522 aa22.1■■□□□ 1.13
GIT2-201ENST00000320063 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GIT2-201ENST00000320063 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.08■■□□□ 1.13
GIT2-201ENST00000320063 IGF1RP08069 1367 aa22.04■■□□□ 1.12
GIT2-201ENST00000320063 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GIT2-201ENST00000320063 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
GIT2-201ENST00000320063 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.01■■□□□ 1.11
GIT2-201ENST00000320063 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GIT2-201ENST00000320063 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.99■■□□□ 1.11
GIT2-201ENST00000320063 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.97■■□□□ 1.11
GIT2-201ENST00000320063 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.97■■□□□ 1.11
GIT2-201ENST00000320063 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.96■■□□□ 1.11
GIT2-201ENST00000320063 APLP2Q06481 763 aa21.89■■□□□ 1.1
GIT2-201ENST00000320063 ARAP1Q96P48 1450 aa21.86■■□□□ 1.09
GIT2-201ENST00000320063 WDR97A6NE52 1622 aa21.84■■□□□ 1.09
GIT2-201ENST00000320063 CUL7Q14999 1698 aa21.79■■□□□ 1.08
GIT2-201ENST00000320063 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.79■■□□□ 1.08
GIT2-201ENST00000320063 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GIT2-201ENST00000320063 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GIT2-201ENST00000320063 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.76■■□□□ 1.07
GIT2-201ENST00000320063 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.75■■□□□ 1.07
GIT2-201ENST00000320063 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.74■■□□□ 1.07
GIT2-201ENST00000320063 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
GIT2-201ENST00000320063 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
GIT2-201ENST00000320063 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.63■■□□□ 1.05
GIT2-201ENST00000320063 ERCC6Q03468 1493 aa21.61■■□□□ 1.05
GIT2-201ENST00000320063 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GIT2-201ENST00000320063 WDR62O43379 1518 aa21.6■■□□□ 1.05
GIT2-201ENST00000320063 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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