RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484130.1

RPL13AP25-201, Transcript of ribosomal protein L13a pseudogene 25, humanhuman

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Gene RPL13AP25, Length 612 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP25-201ENST00000484130 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.25■■■■□ 3.55
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RPL13AP25-201ENST00000484130 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.14■■■□□ 2.58
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RPL13AP25-201ENST00000484130 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
RPL13AP25-201ENST00000484130 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.03■■■□□ 2.56
RPL13AP25-201ENST00000484130 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.92■■■□□ 2.54
RPL13AP25-201ENST00000484130 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.26■■■□□ 2.43
RPL13AP25-201ENST00000484130 SCRIBQ14160 1630 aa30.13■■■□□ 2.41
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RPL13AP25-201ENST00000484130 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.01■■■□□ 2.39
RPL13AP25-201ENST00000484130 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.99■■■□□ 2.39
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RPL13AP25-201ENST00000484130 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.25■■■□□ 2.27
RPL13AP25-201ENST00000484130 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.12■■■□□ 2.25
RPL13AP25-201ENST00000484130 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.96■■■□□ 2.23
RPL13AP25-201ENST00000484130 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
RPL13AP25-201ENST00000484130 SMARCA4P51532 1647 aa28.87■■■□□ 2.21
RPL13AP25-201ENST00000484130 SMARCA2P51531 1590 aa28.76■■■□□ 2.19
RPL13AP25-201ENST00000484130 NCAPD3P42695 1498 aa28.68■■■□□ 2.18
RPL13AP25-201ENST00000484130 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.68■■■□□ 2.18
RPL13AP25-201ENST00000484130 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.62■■■□□ 2.17
RPL13AP25-201ENST00000484130 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.62■■■□□ 2.17
RPL13AP25-201ENST00000484130 HMGXB3Q12766 1538 aa28.59■■■□□ 2.17
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RPL13AP25-201ENST00000484130 WIZO95785 1651 aa28.32■■■□□ 2.12
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RPL13AP25-201ENST00000484130 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.95■■■□□ 2.07
RPL13AP25-201ENST00000484130 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.87■■■□□ 2.05
RPL13AP25-201ENST00000484130 ERCC6Q03468 1493 aa27.86■■■□□ 2.05
RPL13AP25-201ENST00000484130 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.81■■■□□ 2.04
RPL13AP25-201ENST00000484130 NESP48681 1621 aa27.81■■■□□ 2.04
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RPL13AP25-201ENST00000484130 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.74■■■□□ 2.03
RPL13AP25-201ENST00000484130 CFTRP13569 1480 aa27.71■■■□□ 2.03
RPL13AP25-201ENST00000484130 PRDM2Q13029 1718 aa27.54■■■□□ 2
RPL13AP25-201ENST00000484130 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.54■■■□□ 2
RPL13AP25-201ENST00000484130 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.53■■■□□ 2
RPL13AP25-201ENST00000484130 CUX2O14529 1486 aa27.52■■■□□ 2
RPL13AP25-201ENST00000484130 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.52■■■□□ 2
RPL13AP25-201ENST00000484130 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.44■■□□□ 1.98
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RPL13AP25-201ENST00000484130 IFT140Q96RY7 1462 aa26.95■■□□□ 1.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 CUX1P39880 1505 aa26.87■■□□□ 1.89
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RPL13AP25-201ENST00000484130 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
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RPL13AP25-201ENST00000484130 SOGA1O94964 1423 aa26.78■■□□□ 1.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 TOP2BQ02880 1626 aa26.75■■□□□ 1.87
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RPL13AP25-201ENST00000484130 WDR97A6NE52 1622 aa26.72■■□□□ 1.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.72■■□□□ 1.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.67■■□□□ 1.86
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RPL13AP25-201ENST00000484130 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.6■■□□□ 1.85
RPL13AP25-201ENST00000484130 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
RPL13AP25-201ENST00000484130 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RPL13AP25-201ENST00000484130 GRIN2BQ13224 1484 aa26.49■■□□□ 1.83
RPL13AP25-201ENST00000484130 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
RPL13AP25-201ENST00000484130 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RPL13AP25-201ENST00000484130 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.43■■□□□ 1.82
RPL13AP25-201ENST00000484130 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.43■■□□□ 1.82
RPL13AP25-201ENST00000484130 OSCARQ8IYS5 282 aa26.4■■□□□ 1.82
RPL13AP25-201ENST00000484130 PBRM1Q86U86 1689 aa26.38■■□□□ 1.81
RPL13AP25-201ENST00000484130 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.36■■□□□ 1.81
RPL13AP25-201ENST00000484130 KIF27Q86VH2 1401 aa26.33■■□□□ 1.81
RPL13AP25-201ENST00000484130 TRIM41Q8WV44 630 aa26.33■■□□□ 1.81
RPL13AP25-201ENST00000484130 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.33■■□□□ 1.81
RPL13AP25-201ENST00000484130 FBLN2P98095 1184 aa26.31■■□□□ 1.8
RPL13AP25-201ENST00000484130 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
RPL13AP25-201ENST00000484130 SYNJ2O15056 1496 aa26.3■■□□□ 1.8
RPL13AP25-201ENST00000484130 CHD1O14646 1710 aa26.25■■□□□ 1.79
RPL13AP25-201ENST00000484130 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.22■■□□□ 1.79
RPL13AP25-201ENST00000484130 ADAMTS12P58397 1594 aa26.19■■□□□ 1.78
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RPL13AP25-201ENST00000484130 IGF1RP08069 1367 aa26.1■■□□□ 1.77
RPL13AP25-201ENST00000484130 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26■■□□□ 1.75
RPL13AP25-201ENST00000484130 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.98■■□□□ 1.75
RPL13AP25-201ENST00000484130 NUP160Q12769 1436 aa25.98■■□□□ 1.75
RPL13AP25-201ENST00000484130 EEA1Q15075 1411 aa25.98■■□□□ 1.75
RPL13AP25-201ENST00000484130 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.98■■□□□ 1.75
RPL13AP25-201ENST00000484130 CEP170Q5SW79 1584 aa25.9■■□□□ 1.74
RPL13AP25-201ENST00000484130 ARHGEF11O15085 1522 aa25.89■■□□□ 1.74
RPL13AP25-201ENST00000484130 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.88■■□□□ 1.73
RPL13AP25-201ENST00000484130 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.88■■□□□ 1.73
RPL13AP25-201ENST00000484130 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.84■■□□□ 1.73
RPL13AP25-201ENST00000484130 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.84■■□□□ 1.73
RPL13AP25-201ENST00000484130 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.84■■□□□ 1.73
RPL13AP25-201ENST00000484130 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.81■■□□□ 1.72
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