Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms