RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.03■■■■■ 4.48
UPP1-203ENST00000395564 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.12■■■■□ 3.69
UPP1-203ENST00000395564 ABCC9O60706 1549 aa36.84■■■■□ 3.49
UPP1-203ENST00000395564 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
UPP1-203ENST00000395564 NACADO15069 1562 aa35.75■■■■□ 3.31
UPP1-203ENST00000395564 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.72■■■■□ 3.31
UPP1-203ENST00000395564 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.71■■■■□ 3.31
UPP1-203ENST00000395564 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.69■■■■□ 3.3
UPP1-203ENST00000395564 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.68■■■■□ 3.3
UPP1-203ENST00000395564 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.82■■■■□ 3.17
UPP1-203ENST00000395564 SCRIBQ14160 1630 aa34.73■■■■□ 3.15
UPP1-203ENST00000395564 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.55■■■■□ 3.12
UPP1-203ENST00000395564 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.47■■■■□ 3.11
UPP1-203ENST00000395564 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.33■■■■□ 3.09
UPP1-203ENST00000395564 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
UPP1-203ENST00000395564 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.45■■■□□ 2.94
UPP1-203ENST00000395564 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.43■■■□□ 2.94
UPP1-203ENST00000395564 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.37■■■□□ 2.93
UPP1-203ENST00000395564 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
UPP1-203ENST00000395564 SMARCA4P51532 1647 aa33.3■■■□□ 2.92
UPP1-203ENST00000395564 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.13■■■□□ 2.89
UPP1-203ENST00000395564 SMARCA2P51531 1590 aa33.04■■■□□ 2.88
UPP1-203ENST00000395564 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.02■■■□□ 2.88
UPP1-203ENST00000395564 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.02■■■□□ 2.88
UPP1-203ENST00000395564 NCAPD3P42695 1498 aa32.98■■■□□ 2.87
UPP1-203ENST00000395564 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
UPP1-203ENST00000395564 HMGXB3Q12766 1538 aa32.86■■■□□ 2.85
UPP1-203ENST00000395564 WIZO95785 1651 aa32.79■■■□□ 2.84
UPP1-203ENST00000395564 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
UPP1-203ENST00000395564 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
UPP1-203ENST00000395564 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
UPP1-203ENST00000395564 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.1■■■□□ 2.73
UPP1-203ENST00000395564 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.05■■■□□ 2.72
UPP1-203ENST00000395564 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.03■■■□□ 2.72
UPP1-203ENST00000395564 NESP48681 1621 aa31.98■■■□□ 2.71
UPP1-203ENST00000395564 CFTRP13569 1480 aa31.93■■■□□ 2.7
UPP1-203ENST00000395564 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.82■■■□□ 2.68
UPP1-203ENST00000395564 ERCC6Q03468 1493 aa31.75■■■□□ 2.67
UPP1-203ENST00000395564 PRDM2Q13029 1718 aa31.71■■■□□ 2.67
UPP1-203ENST00000395564 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.64■■■□□ 2.66
UPP1-203ENST00000395564 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.64■■■□□ 2.66
UPP1-203ENST00000395564 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.57■■■□□ 2.64
UPP1-203ENST00000395564 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
UPP1-203ENST00000395564 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.45■■■□□ 2.63
UPP1-203ENST00000395564 WDR62O43379 1518 aa31.34■■■□□ 2.61
UPP1-203ENST00000395564 CUX2O14529 1486 aa31.33■■■□□ 2.61
UPP1-203ENST00000395564 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
UPP1-203ENST00000395564 ABCC8Q09428 1581 aa31.26■■■□□ 2.6
UPP1-203ENST00000395564 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.19■■■□□ 2.58
UPP1-203ENST00000395564 TOPBP1Q92547 1522 aa31.17■■■□□ 2.58
UPP1-203ENST00000395564 CUX1P39880 1505 aa31.06■■■□□ 2.56
UPP1-203ENST00000395564 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
UPP1-203ENST00000395564 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
UPP1-203ENST00000395564 TOP2BQ02880 1626 aa30.94■■■□□ 2.54
UPP1-203ENST00000395564 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-203ENST00000395564 IFT140Q96RY7 1462 aa30.92■■■□□ 2.54
UPP1-203ENST00000395564 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.91■■■□□ 2.54
UPP1-203ENST00000395564 SYNJ1O43426 1573 aa30.9■■■□□ 2.54
UPP1-203ENST00000395564 SOGA1O94964 1423 aa30.82■■■□□ 2.52
UPP1-203ENST00000395564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
UPP1-203ENST00000395564 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.76■■■□□ 2.52
UPP1-203ENST00000395564 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
UPP1-203ENST00000395564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.66■■■□□ 2.5
UPP1-203ENST00000395564 WDR97A6NE52 1622 aa30.66■■■□□ 2.5
UPP1-203ENST00000395564 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
UPP1-203ENST00000395564 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
UPP1-203ENST00000395564 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
UPP1-203ENST00000395564 TRIM41Q8WV44 630 aa30.55■■■□□ 2.48
UPP1-203ENST00000395564 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-203ENST00000395564 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-203ENST00000395564 GRIN2BQ13224 1484 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-203ENST00000395564 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.41■■■□□ 2.46
UPP1-203ENST00000395564 KIF27Q86VH2 1401 aa30.37■■■□□ 2.45
UPP1-203ENST00000395564 PBRM1Q86U86 1689 aa30.37■■■□□ 2.45
UPP1-203ENST00000395564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
UPP1-203ENST00000395564 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.31■■■□□ 2.44
UPP1-203ENST00000395564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.3■■■□□ 2.44
UPP1-203ENST00000395564 SYNJ2O15056 1496 aa30.19■■■□□ 2.42
UPP1-203ENST00000395564 IGF1RP08069 1367 aa30.18■■■□□ 2.42
UPP1-203ENST00000395564 ADAMTS12P58397 1594 aa30.16■■■□□ 2.42
UPP1-203ENST00000395564 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.15■■■□□ 2.42
UPP1-203ENST00000395564 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.41
UPP1-203ENST00000395564 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.13■■■□□ 2.41
UPP1-203ENST00000395564 CHD1O14646 1710 aa30.12■■■□□ 2.41
UPP1-203ENST00000395564 CUL7Q14999 1698 aa30.1■■■□□ 2.41
UPP1-203ENST00000395564 FBLN2P98095 1184 aa30.1■■■□□ 2.41
UPP1-203ENST00000395564 EEA1Q15075 1411 aa30.08■■■□□ 2.41
UPP1-203ENST00000395564 OSCARQ8IYS5 282 aa30.08■■■□□ 2.41
UPP1-203ENST00000395564 GRIN2AQ12879 1464 aa30.03■■■□□ 2.4
UPP1-203ENST00000395564 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.02■■■□□ 2.4
UPP1-203ENST00000395564 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.94■■■□□ 2.38
UPP1-203ENST00000395564 NUP160Q12769 1436 aa29.9■■■□□ 2.38
UPP1-203ENST00000395564 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.89■■■□□ 2.38
UPP1-203ENST00000395564 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.89■■■□□ 2.37
UPP1-203ENST00000395564 PRXQ9BXM0 1461 aa29.88■■■□□ 2.37
UPP1-203ENST00000395564 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.84■■■□□ 2.37
UPP1-203ENST00000395564 CEP170Q5SW79 1584 aa29.84■■■□□ 2.37
UPP1-203ENST00000395564 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
UPP1-203ENST00000395564 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.71■■■□□ 2.35
UPP1-203ENST00000395564 KIF21BO75037 1637 aa29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms