Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms