RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366973.8

TATDN3-201, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-201ENST00000366973 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.42■■■□□ 2.62
TATDN3-201ENST00000366973 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.03■■□□□ 1.92
TATDN3-201ENST00000366973 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TATDN3-201ENST00000366973 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.28■■□□□ 1.8
TATDN3-201ENST00000366973 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.04■■□□□ 1.76
TATDN3-201ENST00000366973 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.84■■□□□ 1.73
TATDN3-201ENST00000366973 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
TATDN3-201ENST00000366973 ABCC9O60706 1549 aa25.44■■□□□ 1.66
TATDN3-201ENST00000366973 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.3■■□□□ 1.64
TATDN3-201ENST00000366973 SCRIBQ14160 1630 aa25.15■■□□□ 1.62
TATDN3-201ENST00000366973 NACADO15069 1562 aa25.08■■□□□ 1.61
TATDN3-201ENST00000366973 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.77■■□□□ 1.56
TATDN3-201ENST00000366973 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TATDN3-201ENST00000366973 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.62■■□□□ 1.53
TATDN3-201ENST00000366973 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.48■■□□□ 1.51
TATDN3-201ENST00000366973 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.38■■□□□ 1.49
TATDN3-201ENST00000366973 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.36■■□□□ 1.49
TATDN3-201ENST00000366973 WIZO95785 1651 aa24.22■■□□□ 1.47
TATDN3-201ENST00000366973 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TATDN3-201ENST00000366973 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.07■■□□□ 1.44
TATDN3-201ENST00000366973 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
TATDN3-201ENST00000366973 SMARCA4P51532 1647 aa24.05■■□□□ 1.44
TATDN3-201ENST00000366973 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TATDN3-201ENST00000366973 TRIM41Q8WV44 630 aa23.87■■□□□ 1.41
TATDN3-201ENST00000366973 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.81■■□□□ 1.4
TATDN3-201ENST00000366973 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.71■■□□□ 1.39
TATDN3-201ENST00000366973 SMARCA2P51531 1590 aa23.71■■□□□ 1.39
TATDN3-201ENST00000366973 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TATDN3-201ENST00000366973 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.64■■□□□ 1.37
TATDN3-201ENST00000366973 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TATDN3-201ENST00000366973 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.57■■□□□ 1.36
TATDN3-201ENST00000366973 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.53■■□□□ 1.36
TATDN3-201ENST00000366973 ABCC8Q09428 1581 aa23.47■■□□□ 1.35
TATDN3-201ENST00000366973 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TATDN3-201ENST00000366973 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.36■■□□□ 1.33
TATDN3-201ENST00000366973 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.3■■□□□ 1.32
TATDN3-201ENST00000366973 NCAPD3P42695 1498 aa23.17■■□□□ 1.3
TATDN3-201ENST00000366973 HMGXB3Q12766 1538 aa23.17■■□□□ 1.3
TATDN3-201ENST00000366973 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
TATDN3-201ENST00000366973 SOGA1O94964 1423 aa23.13■■□□□ 1.29
TATDN3-201ENST00000366973 SYNJ1O43426 1573 aa23.07■■□□□ 1.28
TATDN3-201ENST00000366973 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.03■■□□□ 1.28
TATDN3-201ENST00000366973 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TATDN3-201ENST00000366973 EEA1Q15075 1411 aa23.01■■□□□ 1.27
TATDN3-201ENST00000366973 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.98■■□□□ 1.27
TATDN3-201ENST00000366973 HRCP23327 699 aa22.97■■□□□ 1.27
TATDN3-201ENST00000366973 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.96■■□□□ 1.27
TATDN3-201ENST00000366973 TOP2BQ02880 1626 aa22.87■■□□□ 1.25
TATDN3-201ENST00000366973 CFTRP13569 1480 aa22.84■■□□□ 1.25
TATDN3-201ENST00000366973 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.83■■□□□ 1.24
TATDN3-201ENST00000366973 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.81■■□□□ 1.24
TATDN3-201ENST00000366973 CEP162Q5TB80 1403 aa22.81■■□□□ 1.24
TATDN3-201ENST00000366973 GOLGA3Q08378 1498 aa22.81■■□□□ 1.24
TATDN3-201ENST00000366973 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TATDN3-201ENST00000366973 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TATDN3-201ENST00000366973 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.74■■□□□ 1.23
TATDN3-201ENST00000366973 CUX1P39880 1505 aa22.73■■□□□ 1.23
TATDN3-201ENST00000366973 KIF21BO75037 1637 aa22.73■■□□□ 1.23
TATDN3-201ENST00000366973 PRDM2Q13029 1718 aa22.71■■□□□ 1.23
TATDN3-201ENST00000366973 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.67■■□□□ 1.22
TATDN3-201ENST00000366973 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.61■■□□□ 1.21
TATDN3-201ENST00000366973 KIF27Q86VH2 1401 aa22.51■■□□□ 1.19
TATDN3-201ENST00000366973 CLIP1P30622 1438 aa22.5■■□□□ 1.19
TATDN3-201ENST00000366973 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TATDN3-201ENST00000366973 PRXQ9BXM0 1461 aa22.48■■□□□ 1.19
TATDN3-201ENST00000366973 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.46■■□□□ 1.19
TATDN3-201ENST00000366973 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.19
TATDN3-201ENST00000366973 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TATDN3-201ENST00000366973 NESP48681 1621 aa22.42■■□□□ 1.18
TATDN3-201ENST00000366973 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.4■■□□□ 1.18
TATDN3-201ENST00000366973 CUX2O14529 1486 aa22.38■■□□□ 1.17
TATDN3-201ENST00000366973 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.35■■□□□ 1.17
TATDN3-201ENST00000366973 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TATDN3-201ENST00000366973 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.3■■□□□ 1.16
TATDN3-201ENST00000366973 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.29■■□□□ 1.16
TATDN3-201ENST00000366973 IGF1RP08069 1367 aa22.28■■□□□ 1.16
TATDN3-201ENST00000366973 TOPBP1Q92547 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
TATDN3-201ENST00000366973 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TATDN3-201ENST00000366973 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.21■■□□□ 1.15
TATDN3-201ENST00000366973 APLP2Q06481 763 aa22.2■■□□□ 1.15
TATDN3-201ENST00000366973 ARAP1Q96P48 1450 aa22.2■■□□□ 1.14
TATDN3-201ENST00000366973 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.18■■□□□ 1.14
TATDN3-201ENST00000366973 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TATDN3-201ENST00000366973 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.15■■□□□ 1.14
TATDN3-201ENST00000366973 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TATDN3-201ENST00000366973 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.14■■□□□ 1.13
TATDN3-201ENST00000366973 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TATDN3-201ENST00000366973 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.1■■□□□ 1.13
TATDN3-201ENST00000366973 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.09■■□□□ 1.13
TATDN3-201ENST00000366973 WDR97A6NE52 1622 aa22.03■■□□□ 1.12
TATDN3-201ENST00000366973 CUL7Q14999 1698 aa21.98■■□□□ 1.11
TATDN3-201ENST00000366973 ERCC6Q03468 1493 aa21.98■■□□□ 1.11
TATDN3-201ENST00000366973 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TATDN3-201ENST00000366973 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TATDN3-201ENST00000366973 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TATDN3-201ENST00000366973 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.94■■□□□ 1.1
TATDN3-201ENST00000366973 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
TATDN3-201ENST00000366973 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TATDN3-201ENST00000366973 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.86■■□□□ 1.09
TATDN3-201ENST00000366973 P3H3Q8IVL6 736 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.5 ms