RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366974.8

TATDN3-202, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TATDN3-202ENST00000366974 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.77■■□□□ 1.72
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TATDN3-202ENST00000366974 SCRIBQ14160 1630 aa25.03■■□□□ 1.6
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TATDN3-202ENST00000366974 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.19■■□□□ 1.46
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TATDN3-202ENST00000366974 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.64■■□□□ 1.37
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TATDN3-202ENST00000366974 SMARCA2P51531 1590 aa23.54■■□□□ 1.36
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TATDN3-202ENST00000366974 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TATDN3-202ENST00000366974 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.27■■□□□ 1.32
TATDN3-202ENST00000366974 NCAPD3P42695 1498 aa23.23■■□□□ 1.31
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TATDN3-202ENST00000366974 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
TATDN3-202ENST00000366974 SYNJ1O43426 1573 aa22.85■■□□□ 1.25
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TATDN3-202ENST00000366974 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TATDN3-202ENST00000366974 SOGA1O94964 1423 aa22.75■■□□□ 1.23
TATDN3-202ENST00000366974 PRDM2Q13029 1718 aa22.74■■□□□ 1.23
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TATDN3-202ENST00000366974 TOP2BQ02880 1626 aa22.7■■□□□ 1.22
TATDN3-202ENST00000366974 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.68■■□□□ 1.22
TATDN3-202ENST00000366974 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.67■■□□□ 1.22
TATDN3-202ENST00000366974 EEA1Q15075 1411 aa22.67■■□□□ 1.22
TATDN3-202ENST00000366974 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
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TATDN3-202ENST00000366974 KIF21BO75037 1637 aa22.42■■□□□ 1.18
TATDN3-202ENST00000366974 GOLGA3Q08378 1498 aa22.41■■□□□ 1.18
TATDN3-202ENST00000366974 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.4■■□□□ 1.18
TATDN3-202ENST00000366974 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.39■■□□□ 1.18
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TATDN3-202ENST00000366974 CEP162Q5TB80 1403 aa22.32■■□□□ 1.16
TATDN3-202ENST00000366974 NEUROD1Q13562 356 aa22.29■■□□□ 1.16
TATDN3-202ENST00000366974 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.29■■□□□ 1.16
TATDN3-202ENST00000366974 KIF27Q86VH2 1401 aa22.28■■□□□ 1.16
TATDN3-202ENST00000366974 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.27■■□□□ 1.16
TATDN3-202ENST00000366974 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.27■■□□□ 1.15
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TATDN3-202ENST00000366974 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.2■■□□□ 1.14
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TATDN3-202ENST00000366974 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.9■■□□□ 1.1
TATDN3-202ENST00000366974 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TATDN3-202ENST00000366974 CUL7Q14999 1698 aa21.88■■□□□ 1.09
TATDN3-202ENST00000366974 ARAP1Q96P48 1450 aa21.85■■□□□ 1.09
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