Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 C8orf59-204ENST00000523245 799 ntTSL 26.76□□□□□ -1.339e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.689e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.699e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.799e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.879e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.999e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.019e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.029e-32■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 SMTN-224ENST00000624247 1263 ntTSL 520.14■□□□□ 0.811e-17■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.741e-17■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 EXOC5-206ENST00000555148 2349 ntTSL 218.99■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 WDR62-202ENST00000378860 1980 ntTSL 218.84■□□□□ 0.613e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 218.59■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 AP2A1-207ENST00000600466 2903 ntTSL 218.03■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 MUTYH-219ENST00000474703 577 ntTSL 317.7■□□□□ 0.425e-12■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 WDR62-204ENST00000427823 955 ntTSL 516.92■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 WDR62-205ENST00000587391 5971 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 AP2A1-204ENST00000594838 611 ntTSL 315.73■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 SMTN-219ENST00000493335 2937 ntTSL 215.65■□□□□ 0.11e-17■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 SMTN-213ENST00000460658 5080 ntTSL 514.82□□□□□ -0.041e-17■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 SF3A2-204ENST00000589118 759 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.241e-17■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 LTBR-213ENST00000544454 632 ntTSL 513.21□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 PER1-218ENST00000585095 691 ntTSL 312.87□□□□□ -0.357e-8■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 HUWE1-211ENST00000480438 564 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 LTBR-204ENST00000444814 1553 ntTSL 211.75□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 SMTN-215ENST00000472911 543 ntTSL 211.71□□□□□ -0.531e-17■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.443e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 VPS8-206ENST00000426319 185 ntTSL 54.39□□□□□ -1.713e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 EXOC5-209ENST00000556629 693 ntTSL 33.83□□□□□ -1.83e-9■■■■■ 48.7
EFTUD2Q15029 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 SF3A3-208ENST00000489537 891 ntTSL 46.39□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.146e-9■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.794e-9■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 PTAR1-201ENST00000340434 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.824e-9■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.734e-9■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 PTAR1-206ENST00000474925 616 ntTSL 23.79□□□□□ -1.84e-9■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.671e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.671e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-213ENST00000600372 656 ntTSL 317.65■□□□□ 0.421e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.31e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-215ENST00000600796 396 ntTSL 316.8■□□□□ 0.281e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.471e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-207ENST00000596785 712 ntTSL 511.89□□□□□ -0.511e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-214ENST00000600654 895 ntTSL 510.86□□□□□ -0.671e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 KXD1-216ENST00000601630 1327 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-17■■■■■ 48.6
EFTUD2Q15029 PACS1-202ENST00000524784 540 ntTSL 410.6□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 PACS1-211ENST00000531298 547 ntTSL 47.67□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 KRT18-203ENST00000546656 521 ntTSL 213.08□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 KRT18-205ENST00000548496 695 ntTSL 211.86□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NAPRT-207ENST00000464332 1212 ntTSL 218.07■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-211ENST00000533507 1769 ntTSL 226.5■■□□□ 1.831e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-210ENST00000533105 567 ntTSL 420.74■□□□□ 0.911e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-202ENST00000524568 733 ntTSL 218.33■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CCNL2-217ENST00000492998 745 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CCNL2-220ENST00000505849 1503 ntTSL 215.93■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CCNL2-206ENST00000463260 1941 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-209ENST00000531351 423 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CCNL2-214ENST00000482365 2620 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 NDUFS3-208ENST00000530295 253 ntTSL 313.87□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 513.52□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CCNL2-211ENST00000480479 2792 ntTSL 212.97□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 RPSA-207ENST00000478027 1227 ntTSL 211.06□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CCNL2-204ENST00000418865 3082 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 210.46□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 RPSA-209ENST00000495394 2058 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 PDAP1-203ENST00000488214 274 ntTSL 37.03□□□□□ -1.281e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 CENPJ-203ENST00000471870 501 ntTSL 33.49□□□□□ -1.851e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 MIA3-209ENST00000476400 435 ntTSL 31.67□□□□□ -2.141e-8■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 U2SURP-212ENST00000488587 866 ntTSL 33.34□□□□□ -1.873e-7■■■■■ 48.5
EFTUD2Q15029 LMBR1L-227ENST00000552577 2083 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 LMBR1L-228ENST00000552879 568 ntTSL 411.41□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 LMBR1L-224ENST00000552141 756 ntTSL 29.01□□□□□ -0.979e-8■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 NCLN-208ENST00000592737 2735 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 48.4
EFTUD2Q15029 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 48.4
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