RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.98■■■■■ 5.11
LTBR-211ENST00000543190 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.25■■■■■ 4.35
LTBR-211ENST00000543190 ABCC9O60706 1549 aa41.79■■■■■ 4.28
LTBR-211ENST00000543190 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.05■■■■■ 4
LTBR-211ENST00000543190 NACADO15069 1562 aa39.87■■■■□ 3.97
LTBR-211ENST00000543190 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.52■■■■□ 3.92
LTBR-211ENST00000543190 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.18■■■■□ 3.86
LTBR-211ENST00000543190 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.16■■■■□ 3.86
LTBR-211ENST00000543190 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.11■■■■□ 3.85
LTBR-211ENST00000543190 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39■■■■□ 3.83
LTBR-211ENST00000543190 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
LTBR-211ENST00000543190 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.89■■■■□ 3.82
LTBR-211ENST00000543190 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.82■■■■□ 3.8
LTBR-211ENST00000543190 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.58■■■■□ 3.77
LTBR-211ENST00000543190 SCRIBQ14160 1630 aa38.2■■■■□ 3.71
LTBR-211ENST00000543190 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.9■■■■□ 3.66
LTBR-211ENST00000543190 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
LTBR-211ENST00000543190 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.72■■■■□ 3.63
LTBR-211ENST00000543190 NCAPD3P42695 1498 aa36.79■■■■□ 3.48
LTBR-211ENST00000543190 SMARCA4P51532 1647 aa36.62■■■■□ 3.45
LTBR-211ENST00000543190 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.61■■■■□ 3.45
LTBR-211ENST00000543190 SMARCA2P51531 1590 aa36.57■■■■□ 3.45
LTBR-211ENST00000543190 HMGXB3Q12766 1538 aa36.55■■■■□ 3.44
LTBR-211ENST00000543190 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
LTBR-211ENST00000543190 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.43■■■■□ 3.42
LTBR-211ENST00000543190 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
LTBR-211ENST00000543190 CUX2O14529 1486 aa36.19■■■■□ 3.38
LTBR-211ENST00000543190 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.11■■■■□ 3.37
LTBR-211ENST00000543190 ERCC6Q03468 1493 aa36.09■■■■□ 3.37
LTBR-211ENST00000543190 NESP48681 1621 aa35.95■■■■□ 3.35
LTBR-211ENST00000543190 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.94■■■■□ 3.34
LTBR-211ENST00000543190 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.94■■■■□ 3.34
LTBR-211ENST00000543190 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
LTBR-211ENST00000543190 WIZO95785 1651 aa35.67■■■■□ 3.3
LTBR-211ENST00000543190 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.65■■■■□ 3.3
LTBR-211ENST00000543190 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.61■■■■□ 3.29
LTBR-211ENST00000543190 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.58■■■■□ 3.29
LTBR-211ENST00000543190 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
LTBR-211ENST00000543190 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
LTBR-211ENST00000543190 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.31■■■■□ 3.24
LTBR-211ENST00000543190 WDR62O43379 1518 aa35.3■■■■□ 3.24
LTBR-211ENST00000543190 CFTRP13569 1480 aa35.26■■■■□ 3.23
LTBR-211ENST00000543190 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.18■■■■□ 3.22
LTBR-211ENST00000543190 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.14■■■■□ 3.22
LTBR-211ENST00000543190 PRDM2Q13029 1718 aa35.03■■■■□ 3.2
LTBR-211ENST00000543190 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
LTBR-211ENST00000543190 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.84■■■■□ 3.17
LTBR-211ENST00000543190 ABCC8Q09428 1581 aa34.57■■■■□ 3.12
LTBR-211ENST00000543190 TOPBP1Q92547 1522 aa34.51■■■■□ 3.12
LTBR-211ENST00000543190 IFT140Q96RY7 1462 aa34.51■■■■□ 3.11
LTBR-211ENST00000543190 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.44■■■■□ 3.1
LTBR-211ENST00000543190 OSCARQ8IYS5 282 aa34.42■■■■□ 3.1
LTBR-211ENST00000543190 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
LTBR-211ENST00000543190 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
LTBR-211ENST00000543190 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
LTBR-211ENST00000543190 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
LTBR-211ENST00000543190 TRIM41Q8WV44 630 aa34.11■■■■□ 3.05
LTBR-211ENST00000543190 WDR97A6NE52 1622 aa34.08■■■■□ 3.05
LTBR-211ENST00000543190 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.02■■■■□ 3.047e-7■■■■□ 24.2
LTBR-211ENST00000543190 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34■■■■□ 3.03
LTBR-211ENST00000543190 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34■■■■□ 3.03
LTBR-211ENST00000543190 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34■■■■□ 3.03
LTBR-211ENST00000543190 CHD1O14646 1710 aa33.96■■■■□ 3.03
LTBR-211ENST00000543190 SOGA1O94964 1423 aa33.96■■■■□ 3.03
LTBR-211ENST00000543190 CUX1P39880 1505 aa33.94■■■■□ 3.02
LTBR-211ENST00000543190 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.93■■■■□ 3.02
LTBR-211ENST00000543190 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.92■■■■□ 3.02
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF11O15085 1522 aa33.91■■■■□ 3.02
LTBR-211ENST00000543190 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
LTBR-211ENST00000543190 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
LTBR-211ENST00000543190 GRIN2BQ13224 1484 aa33.71■■■□□ 2.99
LTBR-211ENST00000543190 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.69■■■□□ 2.98
LTBR-211ENST00000543190 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.65■■■□□ 2.98
LTBR-211ENST00000543190 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.63■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 SYNJ2O15056 1496 aa33.62■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 PBRM1Q86U86 1689 aa33.61■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 FBLN2P98095 1184 aa33.6■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.6■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 SYNJ1O43426 1573 aa33.59■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.58■■■□□ 2.97
LTBR-211ENST00000543190 ARAP1Q96P48 1450 aa33.56■■■□□ 2.96
LTBR-211ENST00000543190 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.53■■■□□ 2.96
LTBR-211ENST00000543190 TOP2BQ02880 1626 aa33.51■■■□□ 2.96
LTBR-211ENST00000543190 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
LTBR-211ENST00000543190 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.48■■■□□ 2.95
LTBR-211ENST00000543190 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.47■■■□□ 2.95
LTBR-211ENST00000543190 ADAMTS12P58397 1594 aa33.29■■■□□ 2.92
LTBR-211ENST00000543190 GRIN2AQ12879 1464 aa33.28■■■□□ 2.92
LTBR-211ENST00000543190 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.26■■■□□ 2.91
LTBR-211ENST00000543190 NUP160Q12769 1436 aa33.22■■■□□ 2.91
LTBR-211ENST00000543190 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.19■■■□□ 2.9
LTBR-211ENST00000543190 CEP170Q5SW79 1584 aa33.13■■■□□ 2.89
LTBR-211ENST00000543190 SHROOM2Q13796 1616 aa33.12■■■□□ 2.89
LTBR-211ENST00000543190 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
LTBR-211ENST00000543190 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.97■■■□□ 2.87
LTBR-211ENST00000543190 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.83■■■□□ 2.85
LTBR-211ENST00000543190 CUL7Q14999 1698 aa32.79■■■□□ 2.84
LTBR-211ENST00000543190 KIF27Q86VH2 1401 aa32.77■■■□□ 2.84
LTBR-211ENST00000543190 IGF1RP08069 1367 aa32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms