RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614462.4

C8orf59-210, Transcript of chromosome 8 open reading frame 59, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C8orf59, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf59-210ENST00000614462 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
C8orf59-210ENST00000614462 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.56■■■□□ 2
C8orf59-210ENST00000614462 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
C8orf59-210ENST00000614462 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
C8orf59-210ENST00000614462 FOXD1Q16676 465 aa23.68■■□□□ 1.38
C8orf59-210ENST00000614462 POTEDQ86YR6 584 aa23.17■■□□□ 1.3
C8orf59-210ENST00000614462 MSH5O43196 834 aa22.43■■□□□ 1.18
C8orf59-210ENST00000614462 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
C8orf59-210ENST00000614462 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.58■■□□□ 1.05
C8orf59-210ENST00000614462 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.47■■□□□ 1.03
C8orf59-210ENST00000614462 ADRA2BP18089 450 aa21.45■■□□□ 1.02
C8orf59-210ENST00000614462 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.95■□□□□ 0.78
C8orf59-210ENST00000614462 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
C8orf59-210ENST00000614462 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
C8orf59-210ENST00000614462 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
C8orf59-210ENST00000614462 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.11■□□□□ 0.65
C8orf59-210ENST00000614462 RNF39Q9H2S5 420 aa19.08■□□□□ 0.64
C8orf59-210ENST00000614462 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
C8orf59-210ENST00000614462 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
C8orf59-210ENST00000614462 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.73■□□□□ 0.59
C8orf59-210ENST00000614462 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
C8orf59-210ENST00000614462 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.56■□□□□ 0.56
C8orf59-210ENST00000614462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.44■□□□□ 0.54
C8orf59-210ENST00000614462 POTEHQ6S545 545 aa18■□□□□ 0.47
C8orf59-210ENST00000614462 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
C8orf59-210ENST00000614462 KCNA4P22459 653 aa17.97■□□□□ 0.47
C8orf59-210ENST00000614462 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
C8orf59-210ENST00000614462 DSG3P32926 999 aa17.62■□□□□ 0.41
C8orf59-210ENST00000614462 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
C8orf59-210ENST00000614462 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
C8orf59-210ENST00000614462 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
C8orf59-210ENST00000614462 CAPN15O75808 1086 aa17.51■□□□□ 0.39
C8orf59-210ENST00000614462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
C8orf59-210ENST00000614462 ABCB7O75027 752 aa17.05■□□□□ 0.32
C8orf59-210ENST00000614462 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
C8orf59-210ENST00000614462 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C8orf59-210ENST00000614462 SLC4A2P04920 1241 aa16.96■□□□□ 0.31
C8orf59-210ENST00000614462 APLP2Q06481 763 aa16.96■□□□□ 0.31
C8orf59-210ENST00000614462 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.93■□□□□ 0.3
C8orf59-210ENST00000614462 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
C8orf59-210ENST00000614462 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
C8orf59-210ENST00000614462 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
C8orf59-210ENST00000614462 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.74■□□□□ 0.27
C8orf59-210ENST00000614462 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
C8orf59-210ENST00000614462 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.64■□□□□ 0.25
C8orf59-210ENST00000614462 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.56■□□□□ 0.24
C8orf59-210ENST00000614462 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
C8orf59-210ENST00000614462 ZBTB22O15209 634 aa16.47■□□□□ 0.23
C8orf59-210ENST00000614462 POLA2Q14181 598 aa16.44■□□□□ 0.22
C8orf59-210ENST00000614462 AKT1S1Q96B36 256 aa16.28■□□□□ 0.2
C8orf59-210ENST00000614462 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
C8orf59-210ENST00000614462 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.2■□□□□ 0.18
C8orf59-210ENST00000614462 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C8orf59-210ENST00000614462 HAX1O00165 279 aa16.07■□□□□ 0.16
C8orf59-210ENST00000614462 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.05■□□□□ 0.16
C8orf59-210ENST00000614462 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C8orf59-210ENST00000614462 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
C8orf59-210ENST00000614462 PITPNM1O00562 1244 aa15.97■□□□□ 0.15
C8orf59-210ENST00000614462 OSCARQ8IYS5 282 aa15.94■□□□□ 0.14
C8orf59-210ENST00000614462 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
C8orf59-210ENST00000614462 EVX2Q03828 476 aa15.86■□□□□ 0.13
C8orf59-210ENST00000614462 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
C8orf59-210ENST00000614462 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.51■□□□□ 0.07
C8orf59-210ENST00000614462 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.5■□□□□ 0.07
C8orf59-210ENST00000614462 SPDYE6P0CI01 402 aa15.5■□□□□ 0.07
C8orf59-210ENST00000614462 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.5■□□□□ 0.07
C8orf59-210ENST00000614462 LHX8Q68G74 356 aa15.48■□□□□ 0.07
C8orf59-210ENST00000614462 GABBR2O75899 941 aa15.45■□□□□ 0.06
C8orf59-210ENST00000614462 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
C8orf59-210ENST00000614462 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.39■□□□□ 0.05
C8orf59-210ENST00000614462 FBLN2P98095 1184 aa15.32■□□□□ 0.04
C8orf59-210ENST00000614462 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.22■□□□□ 0.03
C8orf59-210ENST00000614462 CHADLQ6NUI6 762 aa15.2■□□□□ 0.02
C8orf59-210ENST00000614462 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
C8orf59-210ENST00000614462 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
C8orf59-210ENST00000614462 POTEIP0CG38 1075 aa15.14■□□□□ 0.01
C8orf59-210ENST00000614462 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.08■□□□□ 0
C8orf59-210ENST00000614462 FKBP8Q14318 412 aa15.06■□□□□ 0
C8orf59-210ENST00000614462 PRR29P0C7W0 189 aa15.04■□□□□ -0
C8orf59-210ENST00000614462 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
C8orf59-210ENST00000614462 CLCN6P51797 869 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf59-210ENST00000614462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
C8orf59-210ENST00000614462 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
C8orf59-210ENST00000614462 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.87□□□□□ -0.03
C8orf59-210ENST00000614462 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.85□□□□□ -0.03
C8orf59-210ENST00000614462 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C8orf59-210ENST00000614462 OTUD5Q96G74 571 aa14.71□□□□□ -0.05
C8orf59-210ENST00000614462 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.66□□□□□ -0.06
C8orf59-210ENST00000614462 POTEB2H3BUK9 544 aa14.63□□□□□ -0.07
C8orf59-210ENST00000614462 POTEMA6NI47 508 aa14.62□□□□□ -0.07
C8orf59-210ENST00000614462 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C8orf59-210ENST00000614462 PROM2Q8N271 834 aa14.62□□□□□ -0.07
C8orf59-210ENST00000614462 FBXO3Q9UK99 471 aa14.62□□□□□ -0.07
C8orf59-210ENST00000614462 POTEGQ6S5H5 508 aa14.55□□□□□ -0.08
C8orf59-210ENST00000614462 CREBZFQ9NS37 354 aa14.53□□□□□ -0.08
C8orf59-210ENST00000614462 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
C8orf59-210ENST00000614462 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.42□□□□□ -0.1
C8orf59-210ENST00000614462 PHF12Q96QT6 1004 aa14.41□□□□□ -0.1
C8orf59-210ENST00000614462 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.39□□□□□ -0.11
C8orf59-210ENST00000614462 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms