RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523245.1

C8orf59-204, Transcript of chromosome 8 open reading frame 59, humanhuman

TSL 2

Gene C8orf59, Length 799 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf59-204ENST00000523245 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
C8orf59-204ENST00000523245 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.11■■□□□ 1.93
C8orf59-204ENST00000523245 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
C8orf59-204ENST00000523245 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
C8orf59-204ENST00000523245 FOXD1Q16676 465 aa22.79■■□□□ 1.24
C8orf59-204ENST00000523245 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.69■■□□□ 1.06
C8orf59-204ENST00000523245 MSH5O43196 834 aa21.44■■□□□ 1.02
C8orf59-204ENST00000523245 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
C8orf59-204ENST00000523245 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.22■□□□□ 0.99
C8orf59-204ENST00000523245 ADRA2BP18089 450 aa21.19■□□□□ 0.98
C8orf59-204ENST00000523245 POTEDQ86YR6 584 aa21.02■□□□□ 0.96
C8orf59-204ENST00000523245 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
C8orf59-204ENST00000523245 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
C8orf59-204ENST00000523245 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.37■□□□□ 0.69
C8orf59-204ENST00000523245 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.97■□□□□ 0.63
C8orf59-204ENST00000523245 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.74■□□□□ 0.59
C8orf59-204ENST00000523245 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.65■□□□□ 0.58
C8orf59-204ENST00000523245 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
C8orf59-204ENST00000523245 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
C8orf59-204ENST00000523245 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
C8orf59-204ENST00000523245 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
C8orf59-204ENST00000523245 RNF39Q9H2S5 420 aa18.23■□□□□ 0.51
C8orf59-204ENST00000523245 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
C8orf59-204ENST00000523245 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.97■□□□□ 0.47
C8orf59-204ENST00000523245 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
C8orf59-204ENST00000523245 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
C8orf59-204ENST00000523245 KCNA4P22459 653 aa17.51■□□□□ 0.39
C8orf59-204ENST00000523245 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
C8orf59-204ENST00000523245 CAPN15O75808 1086 aa17.22■□□□□ 0.35
C8orf59-204ENST00000523245 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
C8orf59-204ENST00000523245 SLC4A2P04920 1241 aa17.11■□□□□ 0.33
C8orf59-204ENST00000523245 DSG3P32926 999 aa17.04■□□□□ 0.32
C8orf59-204ENST00000523245 APLP2Q06481 763 aa17■□□□□ 0.31
C8orf59-204ENST00000523245 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
C8orf59-204ENST00000523245 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
C8orf59-204ENST00000523245 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
C8orf59-204ENST00000523245 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
C8orf59-204ENST00000523245 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
C8orf59-204ENST00000523245 ABCB7O75027 752 aa16.79■□□□□ 0.28
C8orf59-204ENST00000523245 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
C8orf59-204ENST00000523245 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
C8orf59-204ENST00000523245 POTEHQ6S545 545 aa16.49■□□□□ 0.23
C8orf59-204ENST00000523245 POLA2Q14181 598 aa16.41■□□□□ 0.22
C8orf59-204ENST00000523245 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.41■□□□□ 0.22
C8orf59-204ENST00000523245 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C8orf59-204ENST00000523245 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.29■□□□□ 0.2
C8orf59-204ENST00000523245 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
C8orf59-204ENST00000523245 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
C8orf59-204ENST00000523245 ZBTB22O15209 634 aa16.04■□□□□ 0.16
C8orf59-204ENST00000523245 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.99■□□□□ 0.15
C8orf59-204ENST00000523245 AKT1S1Q96B36 256 aa15.91■□□□□ 0.14
C8orf59-204ENST00000523245 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.89■□□□□ 0.13
C8orf59-204ENST00000523245 OSCARQ8IYS5 282 aa15.89■□□□□ 0.13
C8orf59-204ENST00000523245 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
C8orf59-204ENST00000523245 FBLN2P98095 1184 aa15.69■□□□□ 0.1
C8orf59-204ENST00000523245 PITPNM1O00562 1244 aa15.58■□□□□ 0.08
C8orf59-204ENST00000523245 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.57■□□□□ 0.08
C8orf59-204ENST00000523245 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.56■□□□□ 0.08
C8orf59-204ENST00000523245 SPDYE6P0CI01 402 aa15.56■□□□□ 0.08
C8orf59-204ENST00000523245 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.56■□□□□ 0.08
C8orf59-204ENST00000523245 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
C8orf59-204ENST00000523245 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
C8orf59-204ENST00000523245 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
C8orf59-204ENST00000523245 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
C8orf59-204ENST00000523245 HAX1O00165 279 aa15.4■□□□□ 0.06
C8orf59-204ENST00000523245 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.37■□□□□ 0.05
C8orf59-204ENST00000523245 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C8orf59-204ENST00000523245 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.29■□□□□ 0.04
C8orf59-204ENST00000523245 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.25■□□□□ 0.03
C8orf59-204ENST00000523245 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.24■□□□□ 0.03
C8orf59-204ENST00000523245 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
C8orf59-204ENST00000523245 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
C8orf59-204ENST00000523245 PRR29P0C7W0 189 aa15.08■□□□□ 0
C8orf59-204ENST00000523245 EVX2Q03828 476 aa15.06■□□□□ 0
C8orf59-204ENST00000523245 CHADLQ6NUI6 762 aa15.02■□□□□ -0
C8orf59-204ENST00000523245 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf59-204ENST00000523245 GABBR2O75899 941 aa14.78□□□□□ -0.04
C8orf59-204ENST00000523245 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
C8orf59-204ENST00000523245 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.75□□□□□ -0.05
C8orf59-204ENST00000523245 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.75□□□□□ -0.05
C8orf59-204ENST00000523245 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C8orf59-204ENST00000523245 CREBZFQ9NS37 354 aa14.59□□□□□ -0.07
C8orf59-204ENST00000523245 CLCN6P51797 869 aa14.55□□□□□ -0.08
C8orf59-204ENST00000523245 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.53□□□□□ -0.08
C8orf59-204ENST00000523245 LHX8Q68G74 356 aa14.48□□□□□ -0.09
C8orf59-204ENST00000523245 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
C8orf59-204ENST00000523245 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.46□□□□□ -0.09
C8orf59-204ENST00000523245 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
C8orf59-204ENST00000523245 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.43□□□□□ -0.1
C8orf59-204ENST00000523245 POTEIP0CG38 1075 aa14.4□□□□□ -0.1
C8orf59-204ENST00000523245 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.4□□□□□ -0.1
C8orf59-204ENST00000523245 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
C8orf59-204ENST00000523245 PHF12Q96QT6 1004 aa14.28□□□□□ -0.12
C8orf59-204ENST00000523245 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
C8orf59-204ENST00000523245 PROM2Q8N271 834 aa14.25□□□□□ -0.13
C8orf59-204ENST00000523245 PLEKHG5O94827 1062 aa14.2□□□□□ -0.14
C8orf59-204ENST00000523245 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
C8orf59-204ENST00000523245 MIER1Q8N108 512 aa14.13□□□□□ -0.15
C8orf59-204ENST00000523245 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.08□□□□□ -0.16
C8orf59-204ENST00000523245 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms