Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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FOXF1Q12946 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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