Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 IPO4-219ENST00000561379 624 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-10■□□□□ 11
SF3A3Q12874 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.534e-6■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.459e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CIAO1-202ENST00000469320 565 ntTSL 416.96■□□□□ 0.319e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CIAO1-204ENST00000491394 748 ntTSL 214.91□□□□□ -0.029e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-210ENST00000543235 2124 ntTSL 514.66□□□□□ -0.069e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-205ENST00000536201 1592 ntTSL 213.19□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.319e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CIAO1-201ENST00000272402 3588 ntTSL 213.06□□□□□ -0.329e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-206ENST00000537163 2030 ntTSL 513□□□□□ -0.339e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.379e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-211ENST00000544248 1570 ntTSL 512.5□□□□□ -0.419e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-204ENST00000396522 2523 ntTSL 211.92□□□□□ -0.59e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CYB5B-203ENST00000514123 2492 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.52e-15■□□□□ 11
SF3A3Q12874 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.529e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 TCERG1-216ENST00000549332 3518 ntTSL 511.7□□□□□ -0.549e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 BRD3-206ENST00000494743 507 ntTSL 311.63□□□□□ -0.559e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.652e-15■□□□□ 11
SF3A3Q12874 KAZALD1-203ENST00000470106 301 ntTSL 310.74□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.749e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CBR4-207ENST00000510042 1198 ntTSL 210.33□□□□□ -0.769e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ATRX-216ENST00000624403 583 ntTSL 310.31□□□□□ -0.769e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 TMEM150A-205ENST00000422458 803 ntTSL 310.24□□□□□ -0.779e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-15■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-208ENST00000539760 1462 ntTSL 29.39□□□□□ -0.919e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 METTL3-212ENST00000544500 1789 ntTSL 28.91□□□□□ -0.989e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 KAZALD1-205ENST00000477979 754 ntTSL 38.45□□□□□ -1.064e-6■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.099e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-15■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 28.01□□□□□ -1.139e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ERBB3-204ENST00000546748 574 ntTSL 27.91□□□□□ -1.149e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 GTF3C2-210ENST00000480989 604 ntTSL 47.7□□□□□ -1.189e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 MMAB-203ENST00000536760 650 ntTSL 27.56□□□□□ -1.29e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.262e-15■□□□□ 11
SF3A3Q12874 TCERG1-206ENST00000506524 3787 ntTSL 1 (best)6.65□□□□□ -1.349e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 NGDN-211ENST00000556699 725 ntTSL 26.38□□□□□ -1.399e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.49e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ACOX2-210ENST00000480791 693 ntTSL 56.26□□□□□ -1.419e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 VEZF1-201ENST00000258963 3948 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.439e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 TCERG1-215ENST00000515203 576 ntTSL 56.11□□□□□ -1.439e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.449e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.449e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.489e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.59e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.559e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CYB5B-206ENST00000568237 577 ntTSL 54.91□□□□□ -1.622e-15■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.629e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-206ENST00000429703 3443 ntTSL 54.69□□□□□ -1.669e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.699e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ATRX-209ENST00000623242 725 ntTSL 34.33□□□□□ -1.729e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CYB5B-207ENST00000568342 648 ntTSL 54.25□□□□□ -1.732e-15■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)4.12□□□□□ -1.759e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 24.11□□□□□ -1.759e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-209ENST00000441871 556 ntTSL 44.03□□□□□ -1.769e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-218ENST00000487294 587 ntTSL 34□□□□□ -1.779e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.799e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 CBR4-206ENST00000509108 546 ntTSL 33.37□□□□□ -1.879e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 R3HDM1-205ENST00000425804 581 ntTSL 22.53□□□□□ -29e-7■□□□□ 11
SF3A3Q12874 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SELENOH-203ENST00000533321 1454 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.074e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SELENOH-202ENST00000528798 469 ntTSL 213.97□□□□□ -0.174e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SELENOH-205ENST00000534386 1039 ntTSL 212.99□□□□□ -0.334e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EHBP1-215ENST00000469591 886 ntTSL 54.34□□□□□ -1.714e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 HDLBP-220ENST00000442730 683 ntTSL 219.64■□□□□ 0.738e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 HDLBP-240ENST00000484412 669 ntTSL 512.52□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 HDLBP-245ENST00000494862 356 ntTSL 211.47□□□□□ -0.578e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 320.93■□□□□ 0.943e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.793e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-213ENST00000590775 582 ntTSL 517.27■□□□□ 0.363e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 03e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CYTH1-205ENST00000586175 874 ntTSL 210.89□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SEMA3B-205ENST00000434030 1011 ntTSL 319.4■□□□□ 0.71e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SEMA3B-206ENST00000439487 594 ntTSL 317.86■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC13A3-209ENST00000468915 1597 ntTSL 514.13□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-208ENST00000460627 4719 ntTSL 218.71■□□□□ 0.591e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-205ENST00000448472 3547 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-204ENST00000420973 3492 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-212ENST00000470150 4234 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TIAL1-202ENST00000369087 1566 ntTSL 25.86□□□□□ -1.471e-18■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 HLF-209ENST00000575307 582 ntTSL 28.37□□□□□ -1.075e-17■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHKA-203ENST00000525155 1201 ntTSL 511.16□□□□□ -0.629e-12■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHKA-207ENST00000533728 662 ntTSL 29.77□□□□□ -0.859e-12■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 ERBB3-208ENST00000549205 971 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.285e-7■□□□□ 10.9
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