Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG4Q9H9E3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG4Q9H9E3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms