Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPKQ9BS16 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms