Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRB2Q5IJ48 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB2Q5IJ48 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms