Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBK1Q52WX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms