Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SBK1Q52WX2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SBK1Q52WX2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SBK1Q52WX2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SBK1Q52WX2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SBK1Q52WX2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
SBK1Q52WX2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SBK1Q52WX2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SBK1Q52WX2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SBK1Q52WX2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SBK1Q52WX2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SBK1Q52WX2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SBK1Q52WX2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SBK1Q52WX2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SBK1Q52WX2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SBK1Q52WX2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SBK1Q52WX2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SBK1Q52WX2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SBK1Q52WX2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SBK1Q52WX2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SBK1Q52WX2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SBK1Q52WX2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SBK1Q52WX2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SBK1Q52WX2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SBK1Q52WX2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SBK1Q52WX2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SBK1Q52WX2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SBK1Q52WX2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBK1Q52WX2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBK1Q52WX2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBK1Q52WX2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SBK1Q52WX2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SBK1Q52WX2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SBK1Q52WX2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SBK1Q52WX2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SBK1Q52WX2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBK1Q52WX2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SBK1Q52WX2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SBK1Q52WX2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SBK1Q52WX2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SBK1Q52WX2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SBK1Q52WX2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SBK1Q52WX2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SBK1Q52WX2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SBK1Q52WX2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SBK1Q52WX2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SBK1Q52WX2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SBK1Q52WX2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SBK1Q52WX2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SBK1Q52WX2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SBK1Q52WX2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBK1Q52WX2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SBK1Q52WX2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBK1Q52WX2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBK1Q52WX2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SBK1Q52WX2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SBK1Q52WX2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SBK1Q52WX2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SBK1Q52WX2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SBK1Q52WX2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SBK1Q52WX2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SBK1Q52WX2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SBK1Q52WX2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SBK1Q52WX2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SBK1Q52WX2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SBK1Q52WX2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SBK1Q52WX2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SBK1Q52WX2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SBK1Q52WX2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SBK1Q52WX2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SBK1Q52WX2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SBK1Q52WX2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SBK1Q52WX2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SBK1Q52WX2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SBK1Q52WX2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SBK1Q52WX2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SBK1Q52WX2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SBK1Q52WX2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SBK1Q52WX2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SBK1Q52WX2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SBK1Q52WX2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SBK1Q52WX2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SBK1Q52WX2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SBK1Q52WX2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
SBK1Q52WX2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SBK1Q52WX2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SBK1Q52WX2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SBK1Q52WX2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SBK1Q52WX2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SBK1Q52WX2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SBK1Q52WX2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SBK1Q52WX2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SBK1Q52WX2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SBK1Q52WX2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SBK1Q52WX2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SBK1Q52WX2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SBK1Q52WX2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SBK1Q52WX2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SBK1Q52WX2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SBK1Q52WX2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms