Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CASP3-201ENST00000308394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.688e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 TIMELESS-205ENST00000557589 2784 ntTSL 210.47□□□□□ -0.738e-10■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 TIMELESS-201ENST00000229201 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 THAP9-206ENST00000514440 553 ntTSL 410.07□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.858e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 THAP9-202ENST00000505901 3348 ntTSL 21.89□□□□□ -2.114e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.15□□□□□ -2.391e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.421e-13■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 DIP2A-209ENST00000479654 2911 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 FOXK1-203ENST00000496023 1928 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.538e-10■■■■■ 49.7
EFTUD2Q15029 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 521.56■■□□□ 1.041e-9■■■■■ 49.6
EFTUD2Q15029 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 317.47■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 49.6
EFTUD2Q15029 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 315.84■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 49.6
EFTUD2Q15029 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 49.5
EFTUD2Q15029 INTS3-210ENST00000512605 3442 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 49.5
EFTUD2Q15029 INTS3-205ENST00000476843 3404 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 49.5
EFTUD2Q15029 HNRNPU-206ENST00000465881 883 ntTSL 56.47□□□□□ -1.377e-14■■■■■ 49.5
EFTUD2Q15029 HNRNPU-215ENST00000638589 2225 ntTSL 23.38□□□□□ -1.877e-14■■■■■ 49.5
EFTUD2Q15029 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 518.07■□□□□ 0.483e-22■■■■■ 49.4
EFTUD2Q15029 POLD1-211ENST00000600746 999 ntTSL 516.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 BCL2L2-206ENST00000557579 596 ntTSL 314.9□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 STX5-204ENST00000431400 723 ntTSL 214.55□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 BCL2L2-203ENST00000554635 545 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 BCL2L2-202ENST00000553824 548 ntTSL 411.7□□□□□ -0.549e-7■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.046e-14■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 514.04□□□□□ -0.166e-14■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-14■■■■■ 49.3
EFTUD2Q15029 TNRC18-207ENST00000440081 757 ntTSL 310.35□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.76e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.656e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.566e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 216.66■□□□□ 0.266e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.116e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-211ENST00000606066 603 ntTSL 513.83□□□□□ -0.26e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-216ENST00000607212 590 ntTSL 413.8□□□□□ -0.26e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-218ENST00000607814 584 ntTSL 412.97□□□□□ -0.336e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-213ENST00000606782 582 ntTSL 312.79□□□□□ -0.366e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-212ENST00000606394 584 ntTSL 412.64□□□□□ -0.396e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 CTSA-208ENST00000485627 695 ntTSL 39.63□□□□□ -0.876e-11■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 515.66■□□□□ 0.19e-26■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-203ENST00000479629 761 ntTSL 210.9□□□□□ -0.665e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.135e-8■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 416.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 515.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 414.77□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 414.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-218ENST00000528877 546 ntTSL 46.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-203ENST00000414670 500 ntTSL 36.25□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 44.17□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 41.96□□□□□ -2.11e-6■■■■■ 49.2
EFTUD2Q15029 HSPA8-223ENST00000534567 588 ntTSL 44.11□□□□□ -1.752e-13■■■■■ 49.1
EFTUD2Q15029 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 315.65■□□□□ 0.16e-28■■■■■ 49.1
EFTUD2Q15029 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.71e-7■■■■■ 49.1
EFTUD2Q15029 ZNF639-207ENST00000491818 1228 ntTSL 521.43■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 49.1
EFTUD2Q15029 DHX38-213ENST00000569952 638 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 49
EFTUD2Q15029 DHX36-203ENST00000460695 2306 ntTSL 212.06□□□□□ -0.486e-19■■■■■ 49
EFTUD2Q15029 DHX36-208ENST00000479934 530 ntTSL 24.98□□□□□ -1.616e-19■■■■■ 49
EFTUD2Q15029 JAG1-203ENST00000488480 1161 ntTSL 413.05□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 49
EFTUD2Q15029 AKAP9-207ENST00000438114 696 ntTSL 24.56□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 49
EFTUD2Q15029 SREBF2-207ENST00000490262 450 ntTSL 211□□□□□ -0.658e-8■■■■■ 49
EFTUD2Q15029 PPAN-204ENST00000444703 757 ntTSL 325.15■■□□□ 1.622e-8■■■■■ 48.9
EFTUD2Q15029 PPAN-208ENST00000486482 1017 ntTSL 224.44■■□□□ 1.52e-8■■■■■ 48.9
EFTUD2Q15029 PRMT1-211ENST00000528623 543 ntTSL 311.85□□□□□ -0.513e-9■■■■■ 48.9
EFTUD2Q15029 PRMT1-205ENST00000525915 298 ntTSL 33.64□□□□□ -1.833e-9■■■■■ 48.9
EFTUD2Q15029 USP19-211ENST00000479073 360 ntTSL 513.38□□□□□ -0.272e-10■■■■■ 48.9
EFTUD2Q15029 AATK-210ENST00000576053 938 ntTSL 1 (best)21.28■■□□□ 12e-8■■■■■ 48.9
EFTUD2Q15029 AATK-205ENST00000572339 679 ntTSL 416.63■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 48.9
EFTUD2Q15029 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 PCBP4-217ENST00000497653 559 ntTSL 414.88□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 PCBP4-206ENST00000466412 837 ntTSL 413.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 PCBP4-207ENST00000468324 704 ntTSL 313.47□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 PCBP4-213ENST00000489595 539 ntTSL 410.91□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 UBAP2-203ENST00000379235 2673 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.529e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.659e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 27.76□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-210ENST00000589381 738 ntTSL 517.85■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-206ENST00000588300 1055 ntTSL 214.8□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-209ENST00000589214 674 ntTSL 314.58□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-217ENST00000592905 882 ntTSL 214.58□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-213ENST00000592023 738 ntTSL 514.41□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-214ENST00000592083 938 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 48.8
EFTUD2Q15029 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 48.8
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