RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479073.2

USP19-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 5

Gene USP19, Length 360 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-211ENST00000479073 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.97■■■■□ 3.03
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USP19-211ENST00000479073 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.5■■■□□ 2.15
USP19-211ENST00000479073 NACADO15069 1562 aa28.43■■■□□ 2.14
USP19-211ENST00000479073 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.32■■■□□ 2.12
USP19-211ENST00000479073 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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USP19-211ENST00000479073 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.08■■■□□ 2.09
USP19-211ENST00000479073 SCRIBQ14160 1630 aa27.69■■■□□ 2.02
USP19-211ENST00000479073 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.66■■■□□ 2.02
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USP19-211ENST00000479073 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.85■■□□□ 1.89
USP19-211ENST00000479073 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.58■■□□□ 1.85
USP19-211ENST00000479073 SMARCA4P51532 1647 aa26.46■■□□□ 1.83
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USP19-211ENST00000479073 SMARCA2P51531 1590 aa26.22■■□□□ 1.79
USP19-211ENST00000479073 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.2■■□□□ 1.79
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USP19-211ENST00000479073 NCAPD3P42695 1498 aa26.15■■□□□ 1.78
USP19-211ENST00000479073 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.14■■□□□ 1.78
USP19-211ENST00000479073 HMGXB3Q12766 1538 aa26.13■■□□□ 1.77
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USP19-211ENST00000479073 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.5■■□□□ 1.67
USP19-211ENST00000479073 PRDM2Q13029 1718 aa25.4■■□□□ 1.66
USP19-211ENST00000479073 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.37■■□□□ 1.65
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USP19-211ENST00000479073 CFTRP13569 1480 aa25.26■■□□□ 1.63
USP19-211ENST00000479073 CUX2O14529 1486 aa25.23■■□□□ 1.63
USP19-211ENST00000479073 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.15■■□□□ 1.62
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USP19-211ENST00000479073 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.15■■□□□ 1.62
USP19-211ENST00000479073 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.1■■□□□ 1.61
USP19-211ENST00000479073 WDR62O43379 1518 aa25.07■■□□□ 1.6
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USP19-211ENST00000479073 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.79■■□□□ 1.56
USP19-211ENST00000479073 TOPBP1Q92547 1522 aa24.78■■□□□ 1.56
USP19-211ENST00000479073 ABCC8Q09428 1581 aa24.71■■□□□ 1.55
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USP19-211ENST00000479073 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.47■■□□□ 1.51
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USP19-211ENST00000479073 TOP2BQ02880 1626 aa24.41■■□□□ 1.5
USP19-211ENST00000479073 SOGA1O94964 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
USP19-211ENST00000479073 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.38■■□□□ 1.49
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USP19-211ENST00000479073 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
USP19-211ENST00000479073 PBRM1Q86U86 1689 aa24.33■■□□□ 1.49
USP19-211ENST00000479073 CHD1O14646 1710 aa24.32■■□□□ 1.48
USP19-211ENST00000479073 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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USP19-211ENST00000479073 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.24■■□□□ 1.47
USP19-211ENST00000479073 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.15■■□□□ 1.46
USP19-211ENST00000479073 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.15■■□□□ 1.46
USP19-211ENST00000479073 GRIN2BQ13224 1484 aa24.13■■□□□ 1.45
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USP19-211ENST00000479073 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.97■■□□□ 1.43
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USP19-211ENST00000479073 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.92■■□□□ 1.42
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USP19-211ENST00000479073 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
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USP19-211ENST00000479073 KIF27Q86VH2 1401 aa23.84■■□□□ 1.41
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USP19-211ENST00000479073 ARHGEF11O15085 1522 aa23.84■■□□□ 1.41
USP19-211ENST00000479073 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.84■■□□□ 1.41
USP19-211ENST00000479073 CEP170Q5SW79 1584 aa23.81■■□□□ 1.4
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USP19-211ENST00000479073 NUP160Q12769 1436 aa23.72■■□□□ 1.39
USP19-211ENST00000479073 IGF1RP08069 1367 aa23.7■■□□□ 1.38
USP19-211ENST00000479073 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.69■■□□□ 1.38
USP19-211ENST00000479073 SHROOM2Q13796 1616 aa23.66■■□□□ 1.38
USP19-211ENST00000479073 ARAP1Q96P48 1450 aa23.62■■□□□ 1.37
USP19-211ENST00000479073 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.58■■□□□ 1.37
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USP19-211ENST00000479073 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.51■■□□□ 1.35
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