Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms