Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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