RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452145.6

AGAP9-201, Transcript of ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AGAP9, Length 2,387 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9-201ENST00000452145 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.07■■■□□ 2.72
AGAP9-201ENST00000452145 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.57■■■□□ 2
AGAP9-201ENST00000452145 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
AGAP9-201ENST00000452145 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.75■■□□□ 1.87
AGAP9-201ENST00000452145 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.72■■□□□ 1.87
AGAP9-201ENST00000452145 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.37■■□□□ 1.81
AGAP9-201ENST00000452145 ABCC9O60706 1549 aa26.09■■□□□ 1.77
AGAP9-201ENST00000452145 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
AGAP9-201ENST00000452145 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.88■■□□□ 1.73
AGAP9-201ENST00000452145 NACADO15069 1562 aa25.68■■□□□ 1.7
AGAP9-201ENST00000452145 SCRIBQ14160 1630 aa25.67■■□□□ 1.7
AGAP9-201ENST00000452145 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.4■■□□□ 1.66
AGAP9-201ENST00000452145 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
AGAP9-201ENST00000452145 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.03■■□□□ 1.6
AGAP9-201ENST00000452145 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.94■■□□□ 1.58
AGAP9-201ENST00000452145 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.88■■□□□ 1.57
AGAP9-201ENST00000452145 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.87■■□□□ 1.57
AGAP9-201ENST00000452145 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
AGAP9-201ENST00000452145 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.69■■□□□ 1.54
AGAP9-201ENST00000452145 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
AGAP9-201ENST00000452145 WIZO95785 1651 aa24.66■■□□□ 1.54
AGAP9-201ENST00000452145 SMARCA4P51532 1647 aa24.54■■□□□ 1.52
AGAP9-201ENST00000452145 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
AGAP9-201ENST00000452145 TRIM41Q8WV44 630 aa24.27■■□□□ 1.48
AGAP9-201ENST00000452145 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.2■■□□□ 1.46
AGAP9-201ENST00000452145 SMARCA2P51531 1590 aa24.15■■□□□ 1.46
AGAP9-201ENST00000452145 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.14■■□□□ 1.46
AGAP9-201ENST00000452145 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.13■■□□□ 1.45
AGAP9-201ENST00000452145 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.11■■□□□ 1.45
AGAP9-201ENST00000452145 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
AGAP9-201ENST00000452145 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
AGAP9-201ENST00000452145 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
AGAP9-201ENST00000452145 ABCC8Q09428 1581 aa23.86■■□□□ 1.41
AGAP9-201ENST00000452145 NCAPD3P42695 1498 aa23.79■■□□□ 1.4
AGAP9-201ENST00000452145 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.74■■□□□ 1.39
AGAP9-201ENST00000452145 HMGXB3Q12766 1538 aa23.71■■□□□ 1.39
AGAP9-201ENST00000452145 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
AGAP9-201ENST00000452145 SOGA1O94964 1423 aa23.54■■□□□ 1.36
AGAP9-201ENST00000452145 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.49■■□□□ 1.35
AGAP9-201ENST00000452145 SYNJ1O43426 1573 aa23.47■■□□□ 1.35
AGAP9-201ENST00000452145 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.44■■□□□ 1.34
AGAP9-201ENST00000452145 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.41■■□□□ 1.34
AGAP9-201ENST00000452145 CFTRP13569 1480 aa23.39■■□□□ 1.34
AGAP9-201ENST00000452145 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.38■■□□□ 1.33
AGAP9-201ENST00000452145 EEA1Q15075 1411 aa23.36■■□□□ 1.33
AGAP9-201ENST00000452145 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.28■■□□□ 1.32
AGAP9-201ENST00000452145 TOP2BQ02880 1626 aa23.27■■□□□ 1.32
AGAP9-201ENST00000452145 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AGAP9-201ENST00000452145 CUX1P39880 1505 aa23.2■■□□□ 1.3
AGAP9-201ENST00000452145 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.18■■□□□ 1.3
AGAP9-201ENST00000452145 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
AGAP9-201ENST00000452145 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.16■■□□□ 1.3
AGAP9-201ENST00000452145 GOLGA3Q08378 1498 aa23.13■■□□□ 1.29
AGAP9-201ENST00000452145 CEP162Q5TB80 1403 aa23.11■■□□□ 1.29
AGAP9-201ENST00000452145 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.09■■□□□ 1.29
AGAP9-201ENST00000452145 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.09■■□□□ 1.29
AGAP9-201ENST00000452145 PRDM2Q13029 1718 aa23.06■■□□□ 1.28
AGAP9-201ENST00000452145 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
AGAP9-201ENST00000452145 NESP48681 1621 aa23.03■■□□□ 1.28
AGAP9-201ENST00000452145 KIF21BO75037 1637 aa23.02■■□□□ 1.28
AGAP9-201ENST00000452145 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.02■■□□□ 1.28
AGAP9-201ENST00000452145 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23■■□□□ 1.27
AGAP9-201ENST00000452145 KIF27Q86VH2 1401 aa22.96■■□□□ 1.27
AGAP9-201ENST00000452145 HRCP23327 699 aa22.94■■□□□ 1.26
AGAP9-201ENST00000452145 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.9■■□□□ 1.26
AGAP9-201ENST00000452145 PRXQ9BXM0 1461 aa22.89■■□□□ 1.26
AGAP9-201ENST00000452145 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
AGAP9-201ENST00000452145 CUX2O14529 1486 aa22.86■■□□□ 1.25
AGAP9-201ENST00000452145 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.85■■□□□ 1.25
AGAP9-201ENST00000452145 CLIP1P30622 1438 aa22.84■■□□□ 1.25
AGAP9-201ENST00000452145 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
AGAP9-201ENST00000452145 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.8■■□□□ 1.24
AGAP9-201ENST00000452145 IGF1RP08069 1367 aa22.78■■□□□ 1.24
AGAP9-201ENST00000452145 TOPBP1Q92547 1522 aa22.78■■□□□ 1.24
AGAP9-201ENST00000452145 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.78■■□□□ 1.24
AGAP9-201ENST00000452145 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.75■■□□□ 1.23
AGAP9-201ENST00000452145 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.74■■□□□ 1.23
AGAP9-201ENST00000452145 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
AGAP9-201ENST00000452145 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
AGAP9-201ENST00000452145 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.66■■□□□ 1.22
AGAP9-201ENST00000452145 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.65■■□□□ 1.22
AGAP9-201ENST00000452145 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.64■■□□□ 1.21
AGAP9-201ENST00000452145 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.59■■□□□ 1.21
AGAP9-201ENST00000452145 APLP2Q06481 763 aa22.54■■□□□ 1.2
AGAP9-201ENST00000452145 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
AGAP9-201ENST00000452145 ARAP1Q96P48 1450 aa22.53■■□□□ 1.2
AGAP9-201ENST00000452145 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.48■■□□□ 1.19
AGAP9-201ENST00000452145 WDR97A6NE52 1622 aa22.43■■□□□ 1.18
AGAP9-201ENST00000452145 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.42■■□□□ 1.18
AGAP9-201ENST00000452145 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.41■■□□□ 1.18
AGAP9-201ENST00000452145 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.37■■□□□ 1.17
AGAP9-201ENST00000452145 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
AGAP9-201ENST00000452145 CUL7Q14999 1698 aa22.36■■□□□ 1.17
AGAP9-201ENST00000452145 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AGAP9-201ENST00000452145 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
AGAP9-201ENST00000452145 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
AGAP9-201ENST00000452145 P3H3Q8IVL6 736 aa22.33■■□□□ 1.17
AGAP9-201ENST00000452145 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
AGAP9-201ENST00000452145 ERCC6Q03468 1493 aa22.27■■□□□ 1.16
AGAP9-201ENST00000452145 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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