Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP8B1O43520 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms