Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP8B1O43520 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP8B1O43520 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP8B1O43520 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP8B1O43520 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP8B1O43520 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP8B1O43520 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP8B1O43520 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP8B1O43520 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP8B1O43520 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP8B1O43520 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP8B1O43520 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP8B1O43520 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP8B1O43520 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP8B1O43520 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP8B1O43520 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP8B1O43520 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP8B1O43520 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP8B1O43520 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATP8B1O43520 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ATP8B1O43520 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATP8B1O43520 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATP8B1O43520 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP8B1O43520 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP8B1O43520 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP8B1O43520 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATP8B1O43520 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ATP8B1O43520 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP8B1O43520 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP8B1O43520 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP8B1O43520 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP8B1O43520 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP8B1O43520 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP8B1O43520 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATP8B1O43520 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP8B1O43520 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP8B1O43520 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP8B1O43520 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATP8B1O43520 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATP8B1O43520 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATP8B1O43520 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ATP8B1O43520 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATP8B1O43520 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP8B1O43520 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ATP8B1O43520 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP8B1O43520 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP8B1O43520 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP8B1O43520 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP8B1O43520 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP8B1O43520 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ATP8B1O43520 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP8B1O43520 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP8B1O43520 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATP8B1O43520 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATP8B1O43520 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP8B1O43520 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP8B1O43520 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATP8B1O43520 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP8B1O43520 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP8B1O43520 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP8B1O43520 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP8B1O43520 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP8B1O43520 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP8B1O43520 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP8B1O43520 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP8B1O43520 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP8B1O43520 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP8B1O43520 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP8B1O43520 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP8B1O43520 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP8B1O43520 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP8B1O43520 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP8B1O43520 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP8B1O43520 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP8B1O43520 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP8B1O43520 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP8B1O43520 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP8B1O43520 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP8B1O43520 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP8B1O43520 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP8B1O43520 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP8B1O43520 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP8B1O43520 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ATP8B1O43520 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP8B1O43520 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP8B1O43520 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP8B1O43520 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP8B1O43520 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP8B1O43520 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP8B1O43520 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATP8B1O43520 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP8B1O43520 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP8B1O43520 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP8B1O43520 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ATP8B1O43520 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP8B1O43520 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATP8B1O43520 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP8B1O43520 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP8B1O43520 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP8B1O43520 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms