Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms