Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLE2P56282 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLE2P56282 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms