Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ULK4Q96C45 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms