Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYT5O00445 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYT5O00445 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYT5O00445 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms