Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms