RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299576.9

AKIP1-201, Transcript of A-kinase interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKIP1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1-201ENST00000299576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.08■■■■□ 3.37
AKIP1-201ENST00000299576 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.2■■■□□ 2.75
AKIP1-201ENST00000299576 ABCC9O60706 1549 aa31.65■■■□□ 2.66
AKIP1-201ENST00000299576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.36■■■□□ 2.45
AKIP1-201ENST00000299576 NACADO15069 1562 aa30.26■■■□□ 2.43
AKIP1-201ENST00000299576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.21■■■□□ 2.43
AKIP1-201ENST00000299576 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
AKIP1-201ENST00000299576 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.99■■■□□ 2.39
AKIP1-201ENST00000299576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.82■■■□□ 2.36
AKIP1-201ENST00000299576 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.79■■■□□ 2.36
AKIP1-201ENST00000299576 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.32
AKIP1-201ENST00000299576 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.47■■■□□ 2.31
AKIP1-201ENST00000299576 SCRIBQ14160 1630 aa29.38■■■□□ 2.29
AKIP1-201ENST00000299576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.34■■■□□ 2.29
AKIP1-201ENST00000299576 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.06■■■□□ 2.24
AKIP1-201ENST00000299576 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
AKIP1-201ENST00000299576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.64■■■□□ 2.18
AKIP1-201ENST00000299576 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.43■■■□□ 2.14
AKIP1-201ENST00000299576 SMARCA4P51532 1647 aa28.07■■■□□ 2.08
AKIP1-201ENST00000299576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
AKIP1-201ENST00000299576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.91■■■□□ 2.06
AKIP1-201ENST00000299576 NCAPD3P42695 1498 aa27.9■■■□□ 2.06
AKIP1-201ENST00000299576 SMARCA2P51531 1590 aa27.88■■■□□ 2.05
AKIP1-201ENST00000299576 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.82■■■□□ 2.04
AKIP1-201ENST00000299576 HMGXB3Q12766 1538 aa27.78■■■□□ 2.04
AKIP1-201ENST00000299576 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.77■■■□□ 2.04
AKIP1-201ENST00000299576 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
AKIP1-201ENST00000299576 WIZO95785 1651 aa27.56■■■□□ 2
AKIP1-201ENST00000299576 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
AKIP1-201ENST00000299576 NESP48681 1621 aa27.34■■□□□ 1.97
AKIP1-201ENST00000299576 ERCC6Q03468 1493 aa27.27■■□□□ 1.96
AKIP1-201ENST00000299576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.23■■□□□ 1.95
AKIP1-201ENST00000299576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
AKIP1-201ENST00000299576 CUX2O14529 1486 aa27.14■■□□□ 1.94
AKIP1-201ENST00000299576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.12■■□□□ 1.93
AKIP1-201ENST00000299576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.08■■□□□ 1.93
AKIP1-201ENST00000299576 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.08■■□□□ 1.93
AKIP1-201ENST00000299576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.01■■□□□ 1.91
AKIP1-201ENST00000299576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
AKIP1-201ENST00000299576 CFTRP13569 1480 aa26.89■■□□□ 1.9
AKIP1-201ENST00000299576 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.88■■□□□ 1.89
AKIP1-201ENST00000299576 PRDM2Q13029 1718 aa26.81■■□□□ 1.88
AKIP1-201ENST00000299576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.8■■□□□ 1.88
AKIP1-201ENST00000299576 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.79■■□□□ 1.88
AKIP1-201ENST00000299576 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.78■■□□□ 1.88
AKIP1-201ENST00000299576 WDR62O43379 1518 aa26.7■■□□□ 1.87
AKIP1-201ENST00000299576 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
AKIP1-201ENST00000299576 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
AKIP1-201ENST00000299576 TOPBP1Q92547 1522 aa26.36■■□□□ 1.81
AKIP1-201ENST00000299576 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.33■■□□□ 1.81
AKIP1-201ENST00000299576 ABCC8Q09428 1581 aa26.31■■□□□ 1.8
AKIP1-201ENST00000299576 IFT140Q96RY7 1462 aa26.22■■□□□ 1.79
AKIP1-201ENST00000299576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
AKIP1-201ENST00000299576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
AKIP1-201ENST00000299576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
AKIP1-201ENST00000299576 CUX1P39880 1505 aa26.12■■□□□ 1.77
AKIP1-201ENST00000299576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
AKIP1-201ENST00000299576 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.05■■□□□ 1.76
AKIP1-201ENST00000299576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.03■■□□□ 1.76
AKIP1-201ENST00000299576 SOGA1O94964 1423 aa25.99■■□□□ 1.75
AKIP1-201ENST00000299576 TRIM41Q8WV44 630 aa25.98■■□□□ 1.75
AKIP1-201ENST00000299576 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
AKIP1-201ENST00000299576 WDR97A6NE52 1622 aa25.9■■□□□ 1.74
AKIP1-201ENST00000299576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
AKIP1-201ENST00000299576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.88■■□□□ 1.73
AKIP1-201ENST00000299576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
AKIP1-201ENST00000299576 SYNJ1O43426 1573 aa25.86■■□□□ 1.73
AKIP1-201ENST00000299576 TOP2BQ02880 1626 aa25.85■■□□□ 1.73
AKIP1-201ENST00000299576 OSCARQ8IYS5 282 aa25.85■■□□□ 1.73
AKIP1-201ENST00000299576 CHD1O14646 1710 aa25.81■■□□□ 1.72
AKIP1-201ENST00000299576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.76■■□□□ 1.71
AKIP1-201ENST00000299576 PBRM1Q86U86 1689 aa25.75■■□□□ 1.71
AKIP1-201ENST00000299576 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.73■■□□□ 1.71
AKIP1-201ENST00000299576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.72■■□□□ 1.71
AKIP1-201ENST00000299576 GRIN2BQ13224 1484 aa25.72■■□□□ 1.71
AKIP1-201ENST00000299576 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.7■■□□□ 1.7
AKIP1-201ENST00000299576 FBLN2P98095 1184 aa25.68■■□□□ 1.7
AKIP1-201ENST00000299576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
AKIP1-201ENST00000299576 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.58■■□□□ 1.69
AKIP1-201ENST00000299576 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.58■■□□□ 1.69
AKIP1-201ENST00000299576 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.58■■□□□ 1.69
AKIP1-201ENST00000299576 SYNJ2O15056 1496 aa25.57■■□□□ 1.68
AKIP1-201ENST00000299576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
AKIP1-201ENST00000299576 ADAMTS12P58397 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
AKIP1-201ENST00000299576 ARHGEF11O15085 1522 aa25.48■■□□□ 1.67
AKIP1-201ENST00000299576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.46■■□□□ 1.67
AKIP1-201ENST00000299576 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.46■■□□□ 1.67
AKIP1-201ENST00000299576 GRIN2AQ12879 1464 aa25.4■■□□□ 1.66
AKIP1-201ENST00000299576 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.38■■□□□ 1.65
AKIP1-201ENST00000299576 KIF27Q86VH2 1401 aa25.32■■□□□ 1.64
AKIP1-201ENST00000299576 CEP170Q5SW79 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
AKIP1-201ENST00000299576 NUP160Q12769 1436 aa25.27■■□□□ 1.64
AKIP1-201ENST00000299576 ARAP1Q96P48 1450 aa25.27■■□□□ 1.64
AKIP1-201ENST00000299576 CUL7Q14999 1698 aa25.23■■□□□ 1.63
AKIP1-201ENST00000299576 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.23■■□□□ 1.63
AKIP1-201ENST00000299576 IGF1RP08069 1367 aa25.22■■□□□ 1.63
AKIP1-201ENST00000299576 SHROOM2Q13796 1616 aa25.15■■□□□ 1.62
AKIP1-201ENST00000299576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.13■■□□□ 1.61
AKIP1-201ENST00000299576 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
AKIP1-201ENST00000299576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms