Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CDK5R2Q13319 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CDK5R2Q13319 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CDK5R2Q13319 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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